Basic Information
Symbol
CDKN1C
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 1C
KIP2
P57
Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor 1C (P57, Kip2)
Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor P57
Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor 1C
P57Kip2
BWCR
BWS
Beckwith-Wiedemann Syndrome
WBS
Location (GRCh38)
11:2883213-2885775
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_001122630.2
Sequence length
1773.0 nt
GC content
0.6294
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-773.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-800.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
633.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGUGCGCUGUGCUCGAGGGGUGCCGGCCAGGCCUGAGCGAGCGAGCUAG… | 1943 nt | 0.6330 | |
| CCACAGGCCAAGUGCGCUGUGCUCGAGGGGUGCCGGCCAGGCCUGAGCG… | 1773 nt | 0.6294 | |
| CCACAGGCCAAGUGCGCUGUGCUCGAGGGGUGCCGGCCAGGCCUGAGCG… | 1768 nt | 0.6307 | |
| CCACAGGCCAAGUGCGCUGUGCUCGAGGGGUGCCGGCCAGGCCUGAGCG… | 1935 nt | 0.6388 | |
| CCACAGGCCAAGUGCGCUGUGCUCGAGGGGUGCCGGCCAGGCCUGAGCG… | 1236 nt | 0.5518 |
Summary
This gene is imprinted, with preferential expression of the maternal allele. The encoded protein is a tight-binding, strong inhibitor of several G1 cyclin/Cdk complexes and a negative regulator of cell proliferation. Mutations in this gene are implicated in sporadic cancers and Beckwith-Wiedemann syndorome, suggesting that this gene is a tumor suppressor candidate. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2010]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the CDKN1C exhibited decreased mRNA and protein levels in placental samples of smaller twins from growth-discordant dizygotic pairs [Dany Laure Wadji et al. DOI:10.1371/journal.pone.0315549]. In a separate human study, abdominal subcutaneous adipose tissue transcriptome analysis showed that the CDKN1C was down-regulated in response to short-term overfeeding [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970].