Basic Information

Symbol
CDKN2B
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 2B MTS2 P15INK4b INK4B CDK4I TP15 P15 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor 2B (P15, Inhibits CDK4) Cyclin-Dependent Kinase 4 Inhibitor B Multiple Tumor Suppressor 2 P14-INK4b P15-INK4b MTS-2 Cyclin-Dependent Kinases 4 And 6 Binding Protein CDK Inhibitory Protein P14_CDK Inhibitor P15 CDK Inhibitor CDK4B Inhibitor P14_INK4B P15_INK4B P15INK4B
Location (GRCh38)
9:22002903-22009305
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004936.4
Sequence length
3853.0 nt
GC content
0.4423

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1166.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1239.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1073.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004936.4 NCBI
ACUCUGCCAGAGCGAGGCGGGGCAGUGAGGACUCCGCGACGCGUCCGCA… 3853 nt 0.4423
NM_078487.2 NCBI
GGCUCCCCACUCUGCCAGAGCGAGGCGGGGCAGUGAGGACUCCGCGACG… 4001 nt 0.4496
Summary

This gene lies adjacent to the tumor suppressor gene CDKN2A in a region that is frequently mutated and deleted in a wide variety of tumors. This gene encodes a cyclin-dependent kinase inhibitor, which forms a complex with CDK4 or CDK6, and prevents the activation of the CDK kinases, thus the encoded protein functions as a cell growth regulator that controls cell cycle G1 progression. The expression of this gene was found to be dramatically induced by TGF beta, which suggested its role in the TGF beta induced growth inhibition. Two alternatively spliced transcript variants of this gene, which encode distinct proteins, have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for CDKN2B Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CDKN2B (ANRIL/CDKN2B-AS1) was significantly upregulated in the plasma of coronary artery disease (CAD) patients compared to healthy controls and showed significant diagnostic predictive value with an AUC of 0.82 in ROC analysis [Abdallah et al. DOI:10.1007/s40291-022-00622-1].