Basic Information

Symbol
CDR1
RNA class
mRNA
Alias
Cerebellar Degeneration Related 1 CDR34 CDR62A Cerebellar Degeneration-Related Protein 1, 34kDa Cerebellar Degeneration-Related Antigen 1 CDR Cerebellar Degeneration-Related Protein-1 (34kD) Cerebellar Degeneration-Related Protein (34kD) Cerebellar Degeneration Related Protein 1
Location (GRCh38)
X:140783578-140784366
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004065.2
Sequence length
1299.0 nt
GC content
0.4373

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-350.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -371.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 550.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...((.(((....)))))....))))(((((((.(((...(((((....)))))......(.((((..(.(.((....)).).)..)))).)....((((......)))).....(((..(((....)))..)))(((((..((((((((..(((((((((((((...((((..(((((((((...((((.(((....(((((.(.(.((((((((((...((((..((((....((((......))))....)))))))).....((((....((((......))))....))))(((((...((((....(((((...)))))(((..((((.((((....)))).))))..))).(((((((.((((..((((...((((.((..(.(((((((((..(((((..(((.((((((........)))))).)))..)))))....))))))))))..))))))...))))..))))..))).))))......(((((((((.((((((((((..((((..(((((((((...(((.........(((((.(((((((..(((.((((((..(((((..((((((....(((..(((((((.((..((((((..((..((.((.((((((((..((.(((..(((((..(((((.(((..((.(((((((((((((..((.(.(((((..((((..((((((((..((((....)))).))))))))))))..))))).).))..)).)).))))))))).))..))).)))))..)))))..))).))..))))))))))))..))(((((((((((((.((((((..((((..((.(((..(((.(.((((((..(((..((((((((..((((.((.((..(.((((((........)))))).)..)).)).)).))..)))))))).)))....))))))).)))..))..).))..))))..)))))).).))))))))))))((((((((((..(.....).))))))))))))))))..)).))))))))))....)).)).))..)))))..)))))).)))..)))))))))))).........)))...)))).))))).))))..)).)).)))))).)).)))))))((((((((......(((((....)))))...))))))))..))))...))))).....)))))))).)).).))))))...))).)))).....))))))))))))).....)))))))))))))..)))))))))))))))).))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((...((.(((....)))))....))))(((((((.(((...(((((....)))))......(.((((..(.(.((....)).).)..)))).)....((((......))))....{({{..{{||,|.,,,..},|(((((,.{(((((({..((({(((((((({{,,{(((..((((((((({,,((((.(((....,,|||.||||,.||||||||}|||.,|||{|||.,,,||||},,...|||}....}}}}||{{,{{{{{...,),}}}})),||{,{{{,.,.,),},|||,}}|||||.....(((({...})))),,,..|{||,|||{...{|||,.((((..{({.{.(,(((.((((..(((({..((((.((..(.(((((((((..(((((..(((.((((((........)))))).)))..)))))....))))))))))..))))))...)))),.))))..))).).}}}|,.}}||,.|||||.|||||{||||..||||,.{{|||||||...{((,{{{,....({(((.(((((({,,{{{,{{{{,{..|||||,,|||||{,...(({,,(((((((.{(.,(((((({{{{..{{,(|,((((((((,.{{.{((..(((((,,(((({.(((..{{.((((({((({{{(..{{.{,{{{{{..((((..((((((((,.(({{...,||||.|||}}}|}}}}|..|||||,|,||,.}}.|}.||||||}|},|,..}|}.|||||.,}}||}..|||.||..||||||||}},|..,,||||||||,,|||.||,|||..||||}}||||||..|||.|,{|{{{{..||{.,||||||||,,||{{.{{.{{..|.{{{{{{,|......)))))).),,)).}}.}}.))..)))))))),)}},...))))))}})})}.)).,}.}}..)}}).,))))}).||}}}})}||||||{(((((((({..(,....}.}))))))))}}}}},}.,||{|||||||}||..,.}}.},.))..)))))}})))))).))).,}}}}},,))})},,.|,..|,,|,..||||}.}||||.|||||.|,|}}.||||||.}}}|||||}||,||||{|{|{...((((({,.(.{,{|...,)))),,))))))),,..}}.},})}.)))))})},)}.}.}))))).}}))}.))))..},.)))))))}}))))..,,.))))))))))}))..)))))))})))))))).))).)))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004065.2 NCBI
UUGUUGGAAGACAUGAAGAUGCUGGAAGACACAGAGAUGCUGGAAGACG… 1299 nt 0.4373
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.