Basic Information

Symbol
CDYL2
RNA class
mRNA
Alias
Chromodomain Y Like 2 Chromodomain Y-Like Protein 2 CDY-Like 2 FLJ38866 Prostate Cancer Candidate Protein 1, PCCP1 Chromodomain Protein, Y-Like 2 PCCP1
Location (GRCh38)
16:80597907-80804598
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152342.4
Sequence length
8427.0 nt
GC content
0.4576

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2699.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2859.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1910.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_152342.4 NCBI
AGUGGCAGCAGCGUCCGGGCCGGCGGCGGGCGCCGGGCGGCUUCCUGCA… 8427 nt 0.4576
Summary

Predicted to enable transcription corepressor activity. Predicted to be involved in negative regulation of DNA-templated transcription. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CDYL2 was identified as a single-gene biomarker capable of differentiating healthy controls from methamphetamine-dependent subjects without psychosis in a machine-learning analysis of blood transcriptome data [Breen et al. DOI:10.1038/tp.2016.67].