Basic Information

Symbol
ADA2
RNA class
mRNA
Alias
Adenosine Deaminase 2 ADGF CECR1 IDGFL Cat Eye Syndrome Chromosome Region, Candidate 1 Cat Eye Syndrome Critical Region Protein 1 Adenosine Deaminase CECR1 EC 3.5.4.4 SNEDS VAIHS PAN
Location (GRCh38)
22:17178790-17258235
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001282225.2
Sequence length
4355.0 nt
GC content
0.5049

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1407.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1487.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1263.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282225.2 NCBI
AGUUGGUGAGCUUUUCCGGUGCUCUGCACAGAUGCUGGGGCGCUGAGCA… 4355 nt 0.5049
NM_001282226.2 NCBI
AGUUGGUGAGCUUUUCCGGUGCUCUGCACAGAUGCUGGGGCGCUGAGCA… 4322 nt 0.5044
NM_001282227.2 NCBI
AGCCACAGAGGGCCAAUAAAUGGCCCCUUCUGAAUGAGGUGCCCCUGCA… 4272 nt 0.5040
NM_001282228.2 NCBI
AGUUGGUGAGCUUUUCCGGUGCUCUGCACAGAUGCUGGGGCGCUGAGCA… 4230 nt 0.5026
NM_001282229.2 NCBI
AGUUGGUGAGCUUUUCCGGUGCUCUGCACAGAUGCUGGGGCGCUGAGCA… 3987 nt 0.5029
NM_177405.3 NCBI
GUCCUAAUAGCCACGCCCACCUCAAAUGGCGAUCCCAGAGAGCAUCUGG… 3583 nt 0.5010
Summary

This gene encodes a member of a subfamily of the adenosine deaminase protein family. The encoded protein is one of two adenosine deaminases found in humans, which regulate levels of the signaling molecule, adenosine. The encoded protein is secreted from monocytes undergoing differentiation and may regulate cell proliferation and differentiation. This gene may be responsible for some of the phenotypic features associated with cat eye syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

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