Basic Information

Symbol
CEACAM1
RNA class
mRNA
Alias
CEA Cell Adhesion Molecule 1 BGP1 BGP Carcinoembryonic Antigen-Related Cell Adhesion Molecule 1 (Biliary Glycoprotein) Carcinoembryonic Antigen Related Cell Adhesion Molecule 1 Cell Adhesion Molecule CEACAM1 CD66a Antigen CD66a Carcinoembryonic Antigen-Related Cell Adhesion Molecule 1 Biliary Glycoprotein 1 Antigen CD66 BGP-1 BGPI
Location (GRCh38)
19:42507304-42561234
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001712.5
Sequence length
3491.0 nt
GC content
0.4701

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1041.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1102.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 989.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001024912.3 NCBI
AGCACAGAGAGUGGAAAACAGCAGAGGUGACAGAGCAGCCGUGCUCGAA… 3438 nt 0.4686
NM_001184813.2 NCBI
AGCACAGAGAGUGGAAAACAGCAGAGGUGACAGAGCAGCCGUGCUCGAA… 3203 nt 0.4667
NM_001184815.2 NCBI
AGCACAGAGAGUGGAAAACAGCAGAGGUGACAGAGCAGCCGUGCUCGAA… 3296 nt 0.4678
NM_001184816.2 NCBI
AGCACAGAGAGUGGAAAACAGCAGAGGUGACAGAGCAGCCGUGCUCGAA… 3150 nt 0.4651
NM_001205344.2 NCBI
AGCACAGAGAGUGGAAAACAGCAGAGGUGACAGAGCAGCCGUGCUCGAA… 3433 nt 0.4684
NM_001712.5 NCBI
AGCACAGAGAGUGGAAAACAGCAGAGGUGACAGAGCAGCCGUGCUCGAA… 3491 nt 0.4701
Summary

This gene encodes a member of the carcinoembryonic antigen (CEA) gene family, which belongs to the immunoglobulin superfamily. Two subgroups of the CEA family, the CEA cell adhesion molecules and the pregnancy-specific glycoproteins, are located within a 1.2 Mb cluster on the long arm of chromosome 19. Eleven pseudogenes of the CEA cell adhesion molecule subgroup are also found in the cluster. The encoded protein was originally described in bile ducts of liver as biliary glycoprotein. Subsequently, it was found to be a cell-cell adhesion molecule detected on leukocytes, epithelia, and endothelia. The encoded protein mediates cell adhesion via homophilic as well as heterophilic binding to other proteins of the subgroup. Multiple cellular activities have been attributed to the encoded protein, including roles in the differentiation and arrangement of tissue three-dimensional structure, angiogenesis, apoptosis, tumor suppression, metastasis, and the modulation of innate and adaptive immune responses. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been reported, but the full-length nature of all variants has not been defined. [provided by RefSeq, May 2010] CIViC Summary for CEACAM1 Gene

Forensic Context

A study in mice and zebrafish demonstrated that the CEACAM1 transcript increased in relative abundance at 24 hours postmortem in zebrafish [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267]. In a separate study of human patients with acute myocardial infarction, the CEACAM1 mRNA was expressed in platelets and its expression level was negatively correlated with platelet aggregation in response to collagen [Eicher et al. DOI:10.3109/09537104.2015.1083543].