Basic Information

Symbol
CEACAM3
RNA class
mRNA
Alias
CEA Cell Adhesion Molecule 3 CD66d CGM1a CGM1 Carcinoembryonic Antigen-Related Cell Adhesion Molecule 3 Carcinoembryonic Antigen Related Cell Adhesion Molecule 3 Cell Adhesion Molecule CEACAM3 Carcinoembryonic Antigen CGM1 CD66d Antigen Carcinoembryonic Antigen Gene Family Member 1 Nonspecific Cross-Reacting Antigen CD66D W264 W282 CEA
Location (GRCh38)
19:41796587-41811554
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001815.5
Sequence length
1167.0 nt
GC content
0.5638

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-422.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -443.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 340.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001277163.3 NCBI
AGCAGAGCCUAAGUCACAGUAGCCCUGACUACAGCAUUCCUGGAGCCCA… 1062 nt 0.5669
NM_001815.5 NCBI
AGCAGAGCCUAAGUCACAGUAGCCCUGACUACAGCAUUCCUGGAGCCCA… 1167 nt 0.5638
Summary

This gene encodes a member of the family of carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecules (CEACAMs), which are used by several bacterial pathogens to bind and invade host cells. The encoded transmembrane protein directs phagocytosis of several bacterial species that is dependent on the small GTPase Rac. It is thought to serve an important role in controlling human-specific pathogens by the innate immune system. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Mar 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.