Basic Information

Symbol
CECR2
RNA class
mRNA
Alias
CECR2 Histone Acetyl-Lysine Reader KIAA1740 Cat Eye Syndrome Chromosome Region, Candidate 2 Cat Eye Syndrome Critical Region Protein 2 Chromatin Remodeling Regulator CECR2
Location (GRCh38)
22:17359949-17558151
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001290047.2
Sequence length
10030.0 nt
GC content
0.5087

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3428.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3611.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2915.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001290046.2 NCBI
AGGAAAAAGGAUGAACAAAUGCCUGUGUGGUUUCACUUAUAUAGUACUC… 9652 nt 0.4950
NM_001290047.2 NCBI
AUCUGUUUCUCCGGCGGGGACUCGAUUAUAUUGUAGGGGACUGGGGGCG… 10030 nt 0.5087
Summary

This gene encodes a bromodomain-containing protein that is involved in chromatin remodeling, and may additionally play a role in DNA damage response. The encoded protein functions as part of an ATP-dependent complex that is involved in neurulation. This gene is a candidate gene for Cat Eye Syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

A review of postmortem human brain studies found that the CECR2 was downregulated in the anterior cingulate cortex of subjects with major depressive disorder who died by suicide [Yoshino & Dwivedi DOI:10.3389/fpsyt.2020.543893].