Basic Information

Symbol
CELF2
RNA class
mRNA
Alias
CUGBP Elav-Like Family Member 2 BRUNOL3 CUGBP2 Etr-3 Neuroblastoma Apoptosis-Related RNA-Binding Protein CUG Triplet Repeat RNA-Binding Protein 2 CUG-BP- And ETR-3-Like Factor 2 ELAV-Type RNA-Binding Protein 3 RNA-Binding Protein BRUNOL-3 Bruno-Like Protein 3 NAPOR-2 CUG-BP2 CELF-2 NAPOR ETR3 CUG Triplet Repeat, RNA-Binding Protein 2 CUG Triplet Repeat, RNA Binding Protein 2 CUGBP, Elav-Like Family Member 2 KDM2B/CELF2 Fusion HNAPOR DEE97 ETR-3
Location (GRCh38)
10:10798397-11336675
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001326342.2
Sequence length
9406.0 nt
GC content
0.4193

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2577.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2763.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2500.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001326345.2 NCBI
GUCAUUUGAAAUGCGGGGCUGACGGAGCUCUGGUGGCCGGGGGGAAAGA… 7865 nt 0.4139
NM_001326346.2 NCBI
GCCUUUCUUUCCCAGCCACAGCCAGGGUAGGGCUGAUAAGGCGCUGAUG… 7798 nt 0.4193
NM_001326347.1 NCBI
AAUUUGAUGCACACAUGGAUGCCUCGCGCACUCUGCAAAUUCAUCACCC… 2969 nt 0.4678
NM_001326348.2 NCBI
GCCUUUCUUUCCCAGCCACAGCCAGGGUAGGGCUGAUAAGGCGCUGAUG… 7961 nt 0.4195
NM_001326349.2 NCBI
GCCUUUCUUUCCCAGCCACAGCCAGGGUAGGGCUGAUAAGGCGCUGAUG… 9337 nt 0.4146
NM_001394502.1 NCBI
AGUGAGCAGCGACUGUGGCAUUGAUGUUUGAGCAUACUUCUGAACUGGC… 9243 nt 0.4092
NM_001394513.1 NCBI
GCCCCCGCCCGCCGCACCUGGCGCUCGGCAGCCGGCCGCCCCGGCGCUG… 9388 nt 0.4193
NM_001394517.1 NCBI
GCCUUUCUUUCCCAGCCACAGCCAGGGUAGGGCUGAUAAGGCGCUGAUG… 9319 nt 0.4145
NM_001394518.1 NCBI
GCCCCCGCCCGCCGCACCUGGCGCUCGGCAGCCGGCCGCCCCGGCGCUG… 8042 nt 0.4250
NM_001394519.1 NCBI
GCCCCCGCCCGCCGCACCUGGCGCUCGGCAGCCGGCCGCCCCGGCGCUG… 9400 nt 0.4193
Showing 31 to 40 of 41 entries
Summary

Members of the CELF/BRUNOL protein family contain two N-terminal RNA recognition motif (RRM) domains, one C-terminal RRM domain, and a divergent segment of 160-230 aa between the second and third RRM domains. Members of this protein family regulate pre-mRNA alternative splicing and may also be involved in mRNA editing, and translation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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