Basic Information

Symbol
CEND1
RNA class
mRNA
Alias
Cell Cycle Exit And Neuronal Differentiation 1 BM88 Cell Cycle Exit And Neuronal Differentiation Protein 1 BM88 Antigen FLJ90066
Location (GRCh38)
11:787115-790113
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016564.4
Sequence length
1605.0 nt
GC content
0.6636

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-703.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -731.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016564.4 NCBI
GCGUUCGCAGCCGCCGUCAUCCCGCGGAGGAGCGCGCAGCCCCGGGGAG… 1605 nt 0.6636
Summary

The protein encoded by this gene is a neuron-specific protein. The similar protein in pig enhances neuroblastoma cell differentiation in vitro and may be involved in neuronal differentiation in vivo. Multiple pseudogenes have been reported for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CEND1 transcript was downregulated -1.4-fold in the dopamine cell-enriched ventral midbrain of chronic cocaine abusers compared to controls and was identified as a diagnostic biomarker capable of assigning subjects to the cocaine-abusing cohort [Bannon et al. DOI:10.1038/Npp.2014.70].