Basic Information

Symbol
CENPE
RNA class
mRNA
Alias
Centromere Protein E PPP1R61 KIF10 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 61 Centromere-Associated Protein E Kinesin-Related Protein CENPE Centromere Protein E, 312kDa Kinesin-7 CENP-E Centromere Autoantigen E (312kD) Centromere Protein E (312kD) Kinesin Family Member 10 MCPH13
Location (GRCh38)
4:103105349-103198463
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001813.3
Sequence length
8541.0 nt
GC content
0.3505

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1700.99 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1883.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2359.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286734.2 NCBI
CUGGGACCAGUUCAGCCUGAUAGGAUGGCGGAGGAAGGAGCCGUGGCCG… 8178 nt 0.3517
NM_001813.3 NCBI
CUGGGACCAGUUCAGCCUGAUAGGAUGGCGGAGGAAGGAGCCGUGGCCG… 8541 nt 0.3505
Summary

Centrosome-associated protein E (CENPE) is a kinesin-like motor protein that accumulates in the G2 phase of the cell cycle. Unlike other centrosome-associated proteins, it is not present during interphase and first appears at the centromere region of chromosomes during prometaphase. This protein is required for stable spindle microtubule capture at kinetochores which is a necessary step in chromosome alignment during prometaphase. This protein also couples chromosome position to microtubule depolymerizing activity. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct protein isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2014]

Forensic Context

A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation (5 Gy) significantly downregulated centromere protein E (CENPE) expression by 0.32-fold at 3 hours post-exposure, as identified via cDNA microarray analysis [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173].