Basic Information

Symbol
CEP152
RNA class
mRNA
Alias
Centrosomal Protein 152 KIAA0912 SCKL5 MCPH9 Centrosomal Protein Of 152 KDa Centrosomal Protein 152kDa Asterless Microcephaly, Primary Autosomal Recessive 4 Cep152 MCPH4
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001194998.2
Sequence length
5560.0 nt
GC content
0.4034

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1417.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1522.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1533.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.......)))))((((((....(((((((((..(((((((.(((.((.((((..((((.((((........)))).))))...((((((((.((((.((((((...(((.(((....)))..)))(..((((((.(((((((((((((.....((((.....((((((..((((((..............(((.(((((((((((((((..(((((((......((((((((((((.(.....((((.......)))))))))))))(((((.((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((....)))).))))...(((....(((....)))..)))..((((...((((((((..((............)).))))))))....))))...)))))))..)))))).............(((...))).............)))))..))))))).(((((((((.((.((((.((((((((((((..((((.((((.((....((......))((((....))))..((((((....((((.((((((......)))))).)))))))))).........(((((...............(((((((((((((.((((....))))...))))))(((((((((((((((((......(((......))).....))))))))....((((((((...........((((....))))))))))))..((((...(((.....)))....))))............(((((((((..((((((.((((((.......))))))...)))....))))))))))))..............))))))))).....((((((....)))))).)))))))....(((((((....(((((...(((.....((((....))))....)))...))))))))))))((((.......))))..........(((((((...........))))))).......)))))..(((........)))))))))))))((((..((..........((((((........(((((((..((.(((((.(((((((.(..((.((((((...(.((((((...(((.((((((....))))))..))).....)))))))...))))))..))...).))....))))).))))).)).......((.((((.((((((((.((.((((............(((..((....))..)))............)))).)).))))))))))))))....(((..(................)..))).........(((.(((......))))))))))))).....)))))).....((((....(((((((((.((((.((((((..(((((((((((..(((...(((...(((....)))...)))...))).))))))))))).......)))))))))).....((((((............)))))).....................((((....(((((((((.....((((((....((((.(((((....(((..(((.((((...(((..............))).)))).)))....)))((((((((.........(((((((((................))))..))).)).........))))))))...((((((((....)).)))))))))))..))))...)))))).(((((.(.....((((((((((.(((((((.....((((((((((((((((((.....(((((..........))))).....))))).)))....))))..........))))))......)))))))(((........)))...((((((........(((....((((((..(((((.(((.......(((((((...)))))))........(((((((((.............(((((((............((((...(((..((...))..)))....))))............))))))).(((..((....)).))).(((((.(((....))))))))............(((((.(((((((........))))))).)))))..((((....))))....(((.((..((((...((......))....))))..)).))))))))))))(((...)))((..(((((....)))))..)).))).)))))..)))))).....)))......)))))).((((...))))...))))))))))..)))))))))))))))....))))....)))))))))....))))((((((..(((...(((((((((((((((((...........((((.(((((....)))))...))))((((((....((((...(((.(((...((((............).)))))).)))...))))...)))).))............(((((((((((((.......)))))))).)))))....((.(((((....((((((.....................(((.....(((((((........)))))))......)))....((((........))))...............((((.....))))........))))))...))))).))(((..(((.(((.....))))))..)))((((((.(.((((((..((((....(((((...((....(((..........)))....)))))))..)))).......((((((.((((((((..........))))))))..))))))))))))..((((........))))..(((((....)))))...((((((((......))))))))...(((.((((..(((....)))....)))).)))((((((((((..((((.((...((...(((((..((...((((..............................))))...))....))))).))...))))))..).....)))))))))................(((((((((((((...(((((....)))))............(((((.......)))))....((((((..........))))))....(((((((.((((((.(((.(((((..((...)).((((..(((....)))..(((((.((((.(((((((..(((.((((((((..((.((((((((...(((((..(((((((..((...((((.....))))......))..)))))))..)))))........(((.(((((((((..(((....))).))))))))).))).)))))))).)))))))........))).)))...))))))))))).)))))...))))...(((...)))...........))))))))...))))))..)))))))....(((((((.((.....))..).))))))((((.(((((....(((((.((((((..(((.((((((.((((.....(((....)))..........(((((((((....))))))))).))))........(((((((.(((.(((((.....(......).....))))).)))..........(((((((..((((...)))))))))))..........))))))).....((.((((.......)))).))..............((((((..................))))))..(((((((.......(((.....(((((((...)))))))....)))(((((((((((((..((((((((.(((...))))))..)))))...)))))).....))))))).....))))))).(((((........)))))...........((((((((.......)))))))).......))))))..))))))).))..)))))...)))))))))..((((....((((................)))))))).((((((((((((((((.((((.((............)).))))......((((((.................(((((.(((((....)))))...)))))....(((((((((......))))))))))))))).......((((...(((((((((((..............)).))))))))).)))).................((((....))))...(((((......)))))....))))))))))))))))....((((((.(((((.((((((((..((((((((((.......))).)))))))..((.(((.....))).))..........))).)))))...........(((((((((((........))))).)))))).))))).)))))).)))))))))))))....).))))))........))))))))))))))))).(((((((((.(((((....))))).))).))))))........)))..))))))....))..)))))))))))))))).)))).)).)).....)))))))((.((.(((((.............)))))..)).))((((((.(....).)))))).(((((..(((((........(((.(((......))).))).........)))))..))))).((((....))))..........))))))))))).....))))))))))).......(((..((((((........))))))...))).))))))))))...(((((....)))))...)))))))).))))))....))))))...)))).))))))).))))))))))))..)....((((.....))))(((((.(((((.......)))))..))))).....((((.((((((((.((..(((....(((((.((((...(((.....)))...))))..)))))....)))..)).)))...))))))))).....)))))))))))))........(((((...((((....))))....))))).)))))((((((.......(((..(((((((..((((((.(((((.........(((..(((((...(((.(((.....((((((.((((.((((((.(((((.(......))))))..))))))((((..((((........)))).))))...............)))).)))))).......(((((..((.((((.....((((((...........)))))))))).))..)))))(((((((.....)))))))...((((((((((((((............)))))....))))))))).(((((.........))))).))).)))...)).)))..))).....))))).)))))))))))))..))).....)))))).(((((....)))))..)))).))))))))).)))..))))).........))))....))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((.......))))){(((((,.{{{((((((((..(((((((.((,,((.((((,.((((.((((........)))).))))...,,{(((((,{({,.,|||||}}.{{{.(((....}))..)))|,.((((((.((((((((((((({({{.,,({.....{((({(..{{({(({{.,.,,{{.,,..(((.(((((((((((((((..{(((((({.....(({({(((((((.(,.,,.{{{{,.,,,,,})}}|||}}||||(((((,(((((({(({{{(((((({.(((((((((((((((((((((....)))).))))}..(((....(((....)))..))}..((((..,((((({{{,,({....,,....,,},,)))}}))),,}.))))...,))))))..)))))),.............,,...,}},.......,|.||)}})}..|||}|||.,{{{{({{(|{(,((((,(((({{((((((.,{{((,((((.,,..,||{||...||||{{{,,,,}))},.|(((((....((((.((((((......)))))).)))))))))|{{{{{{.||,..,........}}.}}}}}}}|{{({(((((,.,,,||,..||||{{{|||}||(((((((((((((((((......{{{......))).....))))))))....((((((((...........((((....})))))))))))..((((...(((.....)))....))))..........,.(((((((((..(((({{.((((((.......))))))...))),..,}},))))))))}..............))))))))).},.|{({{{{....))))},.}|||,}||,..{{{,.,||,|.,,|||}}}|({{({{{{{{{..........,,|.....}||}|||{{({,,{||}}}}||||||..}}.......(((((((...........))))))).......(((({..(((........))).{|||.,..))))...}}}}}.......{(({.{,.....,.,,|||(({{(...((((((.({.,.....|}..})))))...)))}|,{,.,|||}||||||,,.,)))))},,}}}..,,.}}}}}.,,,{||,},,..|}|}.||,||||,}})}}.}}})}.||.,.....{{.{{({{((((((({.{|.{(({..........,,||{,,||....}}}.}}}..,,,.......}))}.)}.)))))))))))))),...,.|}}}}|....,.,||}},..}},.,|..,,,.,..{(,{{((......|}}},,}})},}}..,.,,)))}}.....||||....|||||||{|.{{{{.||||||..|||||||||||},||{.,.{{|,..|||,,,,|}}.|,))).,.|}},))))|)))}}|,,,..,.|||}}}}))).,..,|||,,,,.,.......,,||||||.,.,,................((({....{{|{|{|||.....{{{{{|,,,.{(((.((({{..{{(((.{(((.((((...(((...........,..}}|.|}}}.}}}....)))|{((((((.,,.....,(((((((((,.....,,,...,}}.))))..})).})......,..))))))}}...((((({{{....}}.))))))}}||}..}}}}...}})))}.((((({(....}|||(((,{((,(((((((.....((((((((((((((((((.....(((((.,,...,,..))))).....))))),,))....)))),.........})))))......))))))){||,..,,,..,,}.,.,{{(((,,.....,((,....,{{{{{.,||{{|,||{..,,,.,||{{{((...||}}}}}.,},....(((((((((.....,,,..,{|,{{(({{............((((...{{...,,...))}),}.....))}},.........,,..|.((({(,....,..}}))}.,..(((((.(((....))))))))............(((((.(((((((.{....,.))))))).)))))..((((....))))....{((.,{..{(({...((,,....||....}})),|}}.)}))))))))))|||...)))((..(((((....)))))..)).}}|,})})),,||}}||.,.,,|||,,,..,||||||,((((...))))...,}}}}}|||||.,|||}|}}}}}}}}).,,.}))),,..,))))}}||,,..,}}}((((((..(((.,.(((((((((((((((({.,,........,(((.((({,..,,||}},...}}}|{((((({{,,((({,.{({,.((,...{{{,..,.........,.}))))),)))|,{|||}...,))).)),......,.,{,{{{{(((((((((.......))))))))}.}}}),......,,(((....|||,{,,||||||....,|,.......{{{.....(((((((........)))))))......}}|....,||,.,,,,...||}....,,,,.......{((((.....)))),...,,|||||||...{|{(({.{((((..(((.(((.....))))))..)))))..))))}),,,})}}{({(....}}},..,......,{{,...,,{(((((((((.{(({{(........,})))}.))},.}))))|||||...}}}.......,,}}...}})),,}}}},...,{{{..,.....}}}}..{((((....))))}.,.((((((((......))))))))...(((.((((..(((....)))....)))).)))(((((((((({,((((.((...({...(((((,,,{...((((.....................,,,,.....)))}...,}....})))).}}...))))))..},....)))))))))................(((((((((((((..,(((((....))))}............{{{{,...{|{{}}}}).,,.((((({..........})))))....(((((((.((((((.(((.(((((,.,,...||.,{{|..(((....)}}..(((((.((((.(((((((((((((....,....(((((..((........))..))))}.{({{{(((....))).}})}((((((((({.({...{{,...,}}.},.,.)))))))))}}....)))))))}(((...((((((((({..{{....,.{{,,...)}}..}}..))))))))))))),))))))))).)))))...}}}}...(({...}))...........,})))))}...)))))}..))))))).,.{(((({{,.||,,,..|||.,.}))))){(((.(((((....(((((.((((((,{{{,{((((,({{{.....(((((((...{{.,,.,{....{((((((((....))))))))).,.))}}}}...))))))),..,..||||,.,,}||..,||,,...{{|||,,.|||....,,,...(({{{{(,,((((,..|}}}}))))))},))).....},,|||.....,||.{{{|.......}})).}}..............((((((..................})))))..(((((((.......(((.....(((((({...}))))))....))}(((((((((((({..((((({(,{(({...})))}}..)))))...)))))).....))))))).....))))))).(((((........))))).............,,||}|}}|}}|{{|{.{{{((....))))),,,}}))))))).))..)))))...))))))))).,|(((....{{((................}}}})))}.((((((((((((((((.((((.({..,,....,,..}}.))})......((((((.................(((({.(((({....}))))...}))))....(((((((((......))))))))))))))).......((((...(((((((((((.............,)).))))))))).))))......,{.........{(({....}}}}...{{{((..,...))})},...))))))))))))))))....((((((.(((((.((((((((..((((((((((.......))).)))))))..{,,,,,.,},{||}..,.....,,,,.))).))))){,,......,,(((((((((((........)))))},))))).))))).)))))).)))))))))))))...,}}}))}}}..,}}.,,})))))))))))))))),(((((((((.(((((....))))).))).))))))........)))..))))))....}}.))))))}))))))))}},)))),)).,}...}}}}}})))||.{|,||||{..........,..)}}}}..}}.,,{|||||,|,.,.).})))}},(((({,,(({{{..,(((,{(,{.(((......})}.||}||...,,,}}}}})..))))}.{{({....})))..}}}....}))))))))))}.....))))}))))))}}.,...(((..((((((........))))))...))).)))))))))}...(((((....)))))..,)))))))).)))))).,.,)))})}...)))))))))))).)))))))))))).,|....((((.....))))(((((.(((((.......)))))..)))))..,,,((((.(((,,(((.((..(((....(((((.((((...(((.....)))...))))..)))))....)))..)}.)))..,))|||}))).....|}}||||||||||,,,{{{{{(((((...((((....))))....)))),.,))))||,,{,....|||{{,,,{{,.,,,.,||(((((((((((((((((...(((((.((((((,.......,....,,,{{,,....((((((.(((({,(......))))))..)))))),{{{..{{{|,,...,||||,..,))),..,,,,{{{.(((((((({.{{{.{{{{,,{,(((((..((.((((.....((((((.{.......,.)))))))))).))..))))}(((((((.....))))))),,}}}}}}..}}}.}.)))))))).}},})))}})).)))))......(((((.........)))))..))))))).))))),...})})}},.,}}})}),)},}}}}})))}}))).,,,,,,.,,,.,{{{{....}}}},..)))).))))))))).)))..))))).........))})}...))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUGACUAGGAAGGAGCUAGUGGACUAGAGCCAGGGUAAGGGGAUCUGCU… 5560 nt 0.4034
GUGACUAGGAAGGAGCUAGUGGACUAGAGCCAGGGUAAGGGGAUCUGCU… 5392 nt 0.4039
Summary

This gene encodes a protein that is thought to be involved with centrosome function. Mutations in this gene have been associated with primary microcephaly (MCPH4). Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.