Basic Information

Symbol
CEP170B
RNA class
mRNA
Alias
Centrosomal Protein 170B KIAA0284 FAM68C Cep170R Centrosomal Protein Of 170 KDa Protein B Cep170-Related Cep170B
Location (GRCh38)
14:104864541-104896770
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001112726.3
Sequence length
6727.0 nt
GC content
0.6634

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3138.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3248.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1486.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((..((((((..((.((((((((((((((((.((((((((((.(.((((((((((((((((((..(.((((((.(((...)))..)))))).)..))))))(((((.((((.(((((((.(((......))).)))))))..)))).))).))...)))))))))))).).).....(((((((((((..((((........))))((((.....((.(((((...))).)).))....((.(((((.....))))).))..((((((...)).))))...)))))))))))))))..)))).))))))))).((...(((((....((((..(((..((((((((((.(((.(((.(((.(((....)))))).)))))).((.((......)))).(((((((.....((......))......)))).))).((((((..((((((..((.(((((..((((((.((.(((..((.(((((((.(((.(.((((.......(((..((((((((...............))))))))...))).......))...)).).)))))))))))).))).))))))))...)))))..(((....)))...((.((((.((.....)).)))).))))...))))))..)))))).(((((((..(((.((((((((((.....((((((.....(((((.(....).))))).....((((((..(((...........(((((...)))))..)))..).)))))))))))(((((((((((..(((((((........(((((..(.((.((((.(((...))).)))).)).)..))))).....))))))).)))....((.(((((((.(((((((((....))))))).))..))))))).))...))))))))..))))))))))..)))..))).)))).....)))))))))))))..)))).)))))..))(((((.((((((.(((((((.(((((..(((.....((((.(((((((((((((((((.(((((((...((((((((((.(((((((((........(((((....)))))...((.((((((((.((..((((((...((.........))..)))))).))..))))).))).))....(((.((((((((((....))))....((((.((....)).)))).(((((.((((((((((((((((...............)))))))))..(((((((((((....((((....((.......))((.((((((.(((.((((.((.(((((...((((.((((.........(((((.(..((((.((..((((.((.(((.....))).)))))))).)))).).)))))))))..))))..))))).)).)))).))....).)))))).))..))))...))))))).)))).........(((((((((((.......((((.((((..((.((......))))...)))).)))).....((((((((((((..(((.((((.(...(((.((((.....).))).))).....).)))).))...((((((......).))))).(((........)))(((((((((((((((((((..(((((((((.(((.........((((((..(...((((...((((....))))))))...)..)))))).......))).))))....(((.(((.((((.((..(((((((((((.(((........))).)))).....))))))).)).))))((((....))))((((((.(((.......))).)).))))..))))))((((((((((((((((......))))))))....(((((((((..(((((......)))..((((..(((.((.......))...)))..)).))....((((...(((((.(((((((((((((((((((.(((.((((.(((((((.((.(.(((((((.((((.((...........((((((((..(((((.(.((((..(((((.......)))))...))))((((((.....((((.(((((((((...............)))))))))..)))))))))).((((.....))))....(((((....(((((.((((....(((.(.(((((((.(((.(((((.((.(.(((....))).).))))))))))))))))).((((((((.(((((.(((((((.((..(((((.(((((.((((..((((((((((......)).)))))))).((((.(((((((((.((....)).))))))))).))))...(((((((.((...)))).)))))....))))..))))).)))))..)).))))))).).(((((((((((.((((((((((((.......(((((.(.(((((.((((.((((((((((((((.(((((.........)))))...(((((((..........((((.((..((((((((..((..(((((..(((((((.((...((((((((...(((.((.(((((.....)))))))..)))..))..((((((.(((((..((.(((((.(((((((.((.....(((.............(.(((.((((..((((((.(((((.((.(((((((....((((((((......(((..(((..((((...((((.....)))).))))..)))))).((..((((((((((((...((.(((((....((((..(((...((((((....).)))))(((((((((((.......((((((.....(((.(((((......))))))))......))).)))...(((.(((((.((.((((((((...(((((((((((.(((.........((.(((((((((...((((((((...(((((((.((..(((....)))(((((((((((......)).)))))..)))).))..).))))))))))))))..((((......)))).......))))))))).)).))))))).)))))))......))).)).))).)).)))).).)))))))))))).))(((((((......)))....)))).((((((......)).)).))((((...)))).........)))..))))...))))).))...)))...))))))))).)).....((((..((((.(((.(....).))).)))).))))))))))))..)))).))))).))))).)).)))).))))))).))))....(((((((((...(((..((.(((.....))).)).)))....)))).)))))...)).)))))))...)))))..))..))))))))))))))))).)))))))..))..)))).)..))..))))))))..)).....)))))))))))..)))))).))).))))).)))))))))..)...)))))((((.(.(.(((.((((((((..(((((..(..(((((((.(((((((..((((((((((...((((((((.(((...(((..(((.....)))..)))((((((((.(((((..(((((((.((......)).)))))))..)))))...(((((((...)))))))((((((((((((((((((((..((((((...((((((((((((...(((((((((((......(((((((((((((....(((.((....)).)))............((((((.((((.((((...(((.(....).))).)))).))))...))))))..)))))))).))))))))))((((..((((((((...))).)))))..))))..))))))...)))))))).....))))..(((((......))))).......(((....))).....((((((.(((.((..(((((((((((..(((..(...(((..((........((((.(((((((...........(((((((....)))))))))))))).)))).(((((..(((.((((((.(........))))))).)))...))))).....))..))).)..)))..))))))....)))))..).).))).)))))).(((((...((((.....))))...)))))((((.((((((((.((((.......((((((....))))))........)))))))).)))).)))))))))).))))))).))).)))))).((((((((......)))).))))))))...((((((((.((.((.....((((..((((((.(.(((((((......(((.((........))))).......)))..)))).).)).)))))))).......)).))))))))))......)))).))))......((((((..(((((((....)))))))((((((((..(..((.((((((.........(.((((((((.......(((....)))(((((((........)))))))((((((..(((((((...))))).))..).)))))..)))))))).).((((..............))))..((((.(((........))).)))).)))))))).)..))))))))..))))))...)))...)))).))))..)))))).)))).((((....))))......)))))..))..))))))).)..)))))))))))))..))).).).)))))))))).))))))))))....(((((....))))).)))))))((((...(((((((.((......)).))).))))..)))).((((......))))...)))))))).))))).)))....)))).))))))))))....).))))))))))))))).))))..)))))....)).).)).))).)))))))).)))))((((.(((((((((((.((((.(((.((((.(((......)))...)))).))))))).......)))))))))))....(((.(((((.(((((...(((.((((((..((((((.....((..(((((((((((((((((.(((((((((((...(((.((.((...((.(((.(((.(((...(((((.((((((((.((.((((((.((..((((....)))).....(((((((((..............((((((.((((((....)))))).))))))(((((((((((.....(((((((((....(((((..(((((...))).((((......)))).....(((((((.((((((...))))))))))))).))..)))))....).)))).))))))))))).)))).)))))))))...(((((((((((((((((.(((((.(((..(.((((((....)))))).)..)))...((((.((((((((((((.(((((..(.(((((((..((((...((..(((((....)).)))..))..........)))).))))))).))))))))))))))(((((.......)))))((((.((((.(((((......(((((....)))))..(((((((......((((((((.(((((.(((((((.((((...(.(((((((....))..))))).)...((((((...(((((((...)))))))...)).)))).....)))))))))))..))))).))))))))..(((.....)))))))))).......(((....))).((((((((...)))))))).))))).))))..))))(((.((((.........(((..((((.....))))..)))......)))))))..))))))))))))).))))))))).(((((.(((((((...........))))))).))))))))))))).)).))))))))....))).)))))((....))((((((....)))))))))))......)))..)))))).)).)).)).))).))))))))))).)))))))..((((.((((.(((((..(.((((.(((((.......))))))))).)....)))).).)).)).))))))))))))))..)).)))))))))))))))...)))).).)).))))))..))))))))))))))).)))))))))))....)))).))))))))))))))).)))).)))))..))))))).))))))))).))).........)..))))))))))))((((((((((...((((........)))).))))))))))))).))))))))...(((((.(((.((((.((((((((....)))))))).....))))))).))))).))))))).)))))........((.((((..(((((((....))))))))))).))))))))))).......))).)))))).))))...........)))).))...)))))))))))))).)))....))))))))))).....((((((....).)))))....))).))))).)))).))).)))))).)))))...................)))))))))))))).))))))))....(((..........(((((((((..(((((....))))))))))))))..........)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{{,((,{((((.((.((((.((({{(((((.....))))))))).)))))).)))),},)}.((((((((((((((((((((((.....))}.))))).))))))))...)))))))|{,((((((((((..((({(.(.((((((((...((({{((((.{.((((((((((...((((((.,...((((((......(((((((({{..(((((((({,...(({,(({{.....((.(((((.....))))).))..(((({,...}}.))))...((((((({{,.{(((({,{.({{((,((,((({(,.,.((((((....)))))}.......|||||||(((.(((.(((,{((....)))))).)))))).{{|||.....}).)).))).|}},}}}.,...)))))))))..(((((.((..((.(((((((({{(((,..(((((..((((((.{{.(((..((.(((((((.(((.(.{{,,..,{{.(((...((((((((...............)))))))).,,),},......}}..,)).),)))))))))))).))).},))))))...)))))..{{{....}}}........,,.((({(((((((.,,.,,(({(({{{{,|{{|||,|..(((((((..(((.((((((((((.....{{{{{(..,..(((((.{....,.)))))...,.(((((,..(((...........(((((...))))),.)))..,.)))))}}}}||(((((((((((..(((((((....,...(((((..(.((.((((.(((...))).)))).)).)..))))).....))))))).))),...((.(((((((.(((((((((....))))))).))..))))))).))...}))))))),,))))))))))..)))..))).))))..,..|,||.,|||)},|.,.(((({(,.{((((.,((({{{,..,(((({(({..,....}}},..|,..}|.}}}...)))}.,,))))|||..}}}))..}}||}|,,,...))}},)}}}}))))}}(((({....})))).))))))).,}))}..{,{,,,,||}..(({........,...}},,)),(((((((((({((((((((,.((......(((((((((.........))))).))))....))..)).))))).)),}))))))))).(((((..,.((((((((.....((,{((((((((((....((((....((.......))((.((((((,(((.((((.((.(((((...((((.((((.........(((((.(..((((.{{,.((((.((.(((.....))).))))))}).)))).).)))))))))..))))..))))).)).)))).))..,,}.)))))).))..))))...))))))).))))}}.,.....))))))))....))))).((((.((((..((.((......))))...)))).)))))))))))))))).))..)).)))))(((,..}}}..((((.....}.)))(((((({...{{{||||....(((({{.,....),))))).|{{,,.,....))).)))))))),.))}},)|}||}}...}))))))))))))...{(((({(..,...({((...((({,,,,}}}}})}},,,),,)))))}..,,}}}}}.{(((((..((....)).)))))),..(((((((((((.(((......,.))).)))).....))))))),).))))))))..))))))...,))))).)...))))).))))).}.)))))))))))))....((((((((......))))))))}))}})).)))}.))))))))))((({(((({.(({,{{{,,,,,{{,(((((.((((({((((((((({(({{((((((..(((((((((((((((((((.(((.((((.((((((({((.(.(,(((((.((((.((...........((((((({.{(((((.{,((((..(((((.......))))).,.))))((((({....,((((.(((((((((.....,,....,,..)))))))))..)))))))))).((((...,.}))}....(((((....(((((.((((..,.(((.{.(((((((((((.(((((.((.(.(((....))).).))))))))))))))))).((((((((.(((({.(((((((.((..(((((.(((((.((({..((((((((((......)).)))))))).((((.(((((((((.((....)).))))))))).))))...((((({,.((...}},,.)))))....))}),,))))).)))))..)).))))))).}.(((((((((((.((((((((((((....{{.(((((.(.(((((.((((.((((((((((((((.(((((.........)))))...(((((((.,......,,(({{,({..((((((((..((.,,((((..(((((((.((...(((((,((...(({.((.(((((.....)))))))..))}..)).,(((((,{(((((..((.(((((.(((((((.((..{{(({({{{...,,{,,.,{,(({.((((..((((((.(((((.({.(((((((..,.((((((((.....{(((..(((..((((...((((.....)))).))))..)))))){((.{((((((((((((...((.(((((....((((..(((...((((((....)}})))){((((((((((.......((((((.....(({{(((((......))))))))......))).)))...(((.(((((.((.((((((((...(((((((((((.(((.........((.(((((((((...((((((((...(((((({.,,..,{{...,||,(((((((((({......)).)))))..)))).,)},).))))))))))))))..((((......)))).......))))))))).)).))))))).)))))))......))).))}})).)).)))).).)))))))))))).}}({{((({......}}}...,)))}.((({{{.....,))..}.}}((((...)))).........)))..))))...))))).))...))),..)))))))))}}...))}((((..((((.(((.{....}.))).)))).)))))))))))).,)))).)))}).))))).)).)))).))))))),}.))}...)))|||,}|}|.(((,...,|||.....|||.,..))){.({{{...)))),...)).)))))))...)))))..))..))))))))))))))))).)))))))..))..)))).}..))..))))))))..)),}....,}})))))))..)))))).))).))))).)))))))))..}...))))){{||{{,(,(((.((((((((..(((((..(..((((((({(.(((((..((((((((((...((((((((.(((.((((...((({{,.{{({{(((,({((({((.(((((..(((((((.((......)).)))))))..)))))},.(((((((...}}}}|||.{,(((((((((((((((((..((((((,..,{{{,(((((((((((((((.(((.(((.((((((((.((...((((.,....})))))).))))).)))..))).))).))))))){{{{{,,,.{{{,,..,,|.|||.((((((((((.(((..((....))...,.,(((((..{.((((..((((((((...)))},))))..))))}.))))))..))).))))))))))..))..(((((......)))))....})))})))||,,{{{{{,((((((.({(,((,.(({{{{|{{{{,,||(......{{{..{{..,,....{{{|,|((((((,.{{.,,,||{(((((((..,,)))))}}}}))))),)))).(((({..(((.((((((.(........))))))).)))...})))).....)},,}}}.,,}))).,}))))).,,})))))..}.}.))),)))))).(((((...((((.....))))...))))){(((.((((((((.((((......,((((((....)))))),.......)))))))).)))).)))))))))).)))))))},)).})))))),.}||((((((((((((({.({{{{.....{{(.(({..{{{{|..,,....}.,))).,.)))))),|}}}}}..,((({(({....,,.||,,....,,..(((((((((...(((((((..((,,.....,...{||||(({{......|{||(.|,..)))}},.....))}}.}}}}..,,.))))))))))))))))},||.,,|}}{||,,..,,,.|.((((((((.......(((....)))(((((((........)))))))((((({..(((((((...))))).))..}.)))))..)))))))).,.((((,.,,....},....)))).,}))))}}}.}}}}}..)},.,)))))})))))}}}...,.))))),}))..)))).)))...)))).))))..))))))}}))).((((....))))......))))),,)}..))))))).)..)))))))))))))..))),).)))),.)))))).)))))))))}....(((((....))))),)))))))((((...(((((((.((......)).))).))))..)))).((({......)))}...))))))))},)))}.))).}..)))).))))))))))...,},))))))))))))))).))))..))))),).),)})})}.})),)))))))).))))}((((.(((((((((((.(((,,(((.((((.(((......)))...)))).))))))).......)))))))))))....(((.(((((.({(((,..(((.((((((..((((((.....{{..(((((((((((((((((.(((((((((((...(((.((.{,,,.((.((,{(((.(((,,,(({({.((((((((.({.(({{{(,({..((((....)))).....(((((((((..............((((((.{(((((....)))))).)))))){((((((((((.....(((((((((....(((((..{((((...)))}((((......)))).....(((((((.((((((...))))))))))))).,}..)))))....).)))).))))))))))))}})}.))))))))),,,(((({{{|(((((((((.(((((.(((..(.((((((....)))))).},.)))...((((.(((((((((({{{(((((..(.(((((((..((((...{,..,((((,.{.||.,,),,))}}........)))).))))))).))))))))))))))(((((.......)))))((((.((({.{{{{{,,||,.{||,{....||||,..(((((((......((((((((.(((((.{((((((.((((,,.{{{{{{,{{,,,.}},((|||{(({,.({((((...,||||{|,..,)))})),}})},||}}..)).}))))))))),,,))))).))))))))..(((.....))))))))))...}},,(((....))).((((((((...)))))))).})))}.)))),,)))){{{.{{,(,.{{{{...(((..((((.....))))..)))......)})))),}))))}))))))))).))))))))){{{{{{.{{{{{||,......,{,,|}|||}},||||||||}|}||,}}.}}}}})))},},))),))}})||.)))))((((((....))))))}}}}}.,....)))..)))))).)).)).)).))).))))))))))).)))))))..((((.((((.(((((..(.((((.(((((.......))))))))).),...)))).).)).)).))))))))))))))..)).)))))))))))))))...)))).).)).))))))..)))))))))))))))))))))).,,,.....}}||||||}(((,{((((...(((((((.,.....,.)))))))..)))))))),|.|||||.{|{{{.|,|.(((((((((((((({.{,((((.{......}}}),})}))))))}..{.((..((((...(((((.(((.(((({((((((((....))))))))..},.})))))).)))))..)))).)),,.,,,,}},,({(..((((..(((((((....))))))))))).))).,.......})))))(((((.(((((((.(((.......)))))),,))).)))))......}}))))))))}...)))}})))))((((((,{.....(((((({(((........)))).))))))..}}.)))))).)).))))...))))),}},,)}})))),,}))){{|,,,..,))...,{{{,........(((((((((..(((({....})))))))))))))......,,,.,,)))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001112726.3 NCBI
AGACGUCAGGGACCCGCGCGCGAGGCCGCCGGCGGCCGCUCUGCCGUGG… 6727 nt 0.6634
NM_015005.3 NCBI
AGACGUCAGGGACCCGCGCGCGAGGCCGCCGGCGGCCGCUCUGCCGUGG… 6700 nt 0.6631
Summary

Predicted to be located in cytoplasm and microtubule. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CEP170B was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].