Basic Information

Symbol
ADAM12
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase Domain 12 MLTN MCMPMltna Disintegrin And Metalloproteinase Domain-Containing Protein 12 Meltrin-Alpha A Disintegrin And Metalloproteinase Domain 12 (Meltrin Alpha) Metalloprotease-Disintegrin 12 Transmembrane Meltrin Alpha EC 3.4.24.58 EC 3.4.24.- ADAM12-OT1 EC 3.4.24 ADAM 12 CAR10 MLTNA MCMP
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001288973.2
Sequence length
7941.0 nt
GC content
0.4701

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2498.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2648.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2012.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.(((((((((((......(((((((.((((((((((((((.((..(((.(((.((.........))))).)))..)).))))).(((((.....)))))(((.(((....))).))).......))))).....(((((........)))))))))))))))).((....(.((((((((((((.((..(((((.((..((.(((.((..((((.........)))))))))))..))...)))))..)).)))))))))))).)..))((((.((..(((.((((((.(...((.((....)).))...).)))))).)))..)).))))(((..((((((((((((((((...((((((....(((((((((...(((.((....(((((.....)))))))))).)))))))))....))......(((((((...........((((((((((((((.((.((((((..(((((((((.........(((......)))........)))))))(.(((((.....(((.......)))....((((.(((((..((((...(((....))).)))).))).)).))))))))).).....))...)))))).)).)).))).)))))))))(((.((((.(((((........)))))..........((((.((((((((.(.(((((...(((......)))...))))).).))))))))))))...)))))))...(((((((((.........(((...((...........))..)))........))))))))).)))))))((((......))))....)))).))))).....(((((.(((((................((........)))))))..)))))..........))))))))).))..)))......))))))......))))).....((.(.((((((((((..((......))..)))...))))))).).)).((((((((...((((((((((((.(((((((((......))))))(((((((((..((..(((((...(((..(((((((((.(((..(((..((((...((((((((((...(((((((......))).((((.....))))..........((((((((.....(((((.(((((((((.(((.......))).)))).......((((((((..((((((((((((.(((((((((.........))))).)))).))))((((((...(((((.((..(.(((((((.(((((....((((((.(((((.((((...))))))))))))))))))).).)))))).).)..)).)))))...))))))....(((((..((........))..)))))....)))))).)))))))..)))))))).)))))))))))))..))))..))))))))))....))))))).)))...)))))))))..)))......(((.(((((.(((((...((((((((((....((((((..(.((..((...))..)))(((((((((((.......(((((.(((.((((.((....)).)))).))).(((((((((((((((((.((((((((.((..((((((.((.((...(.(((((((..((.(.((((((((.((((..(((((((((.((.((((.((....(((((.((.((((.(.(((((.((((.((((((((.(.....).))))))..)).))))....((((((..(((...))).....)))))))).))).).)))).)).)))))..(((((....))))).)).)))).))))))(((((((.(((((((.(((((....((((....))))........))))).))).))))..((.(((((((((((((.....)))))(((((((((((((((((....(.((...(((((...((.((((((((((((....((((((((.(((...)))...))))))))..)))((((((((((((((((..((((((......(((.(((.(((.((((((((.(((((((((...((((....))))(((((....)))))..........((((((...((((((....(((((....(((((.((((........)))).....(((.(((........))).)))((((((((((((...))).((((((......)))))).....((((.(((.((((((((....))).))))).))).))))..(((((.((..(.(((.(((..((((((...........((((((......(((((((((....(((((.......(((((.(((.......(((((..(((((..(((((((((((((....((((((((.(((((..((..(((....((((.........))))......)))..))..)).)))))))))))....(((((.(((....))).))))).........))))))))...............((((.(((......))))))))))))..)))))..)))))....(((((((((.....(((((((((..((..((...))..))....))))))))).)))))))))............))).)))))........(((.(.((((((..(((((((....))))))))))))).).)))....(((.(((.......)))))))))))...))).)).))))))))))))))))..)))))).)..)))))))((.((......)).)).((((((...(((..(((((....))))).))).)))))).)))))))))....)))))..)))))))))))..))))))....(((((((((........(((........))))))))))))..((((......)))).))))))...))).)))))))))))..)))))).)))))).......((((..(((((((.((((..(((.....(((..(((((((.(((((((((((...........(((((((((((((.....(((((((....(((((((((((((...........))))))....))).......(((((..........)))))..............(((.((((....)))))))..))))....)))))))))))))).........((((...(((((((...)))))))..((((((((.((((((((((...)))))))))).)))))))))))).))))))((((((((......))))))))))))).)))))).(((((((((.....)))))))))...))))))))))....)))...)))).)).((((((((((((.........))))))))))))((((((((((((.....(((.((.(((((((..(((((((((((...(((.....((((.(((...(((((..(((((((((.............(((((...((((((((..(((((((((((((....))))))....)))...)))).))))))))....)))))((((((.((((((((....))))))))...((((((((((.((((((....)))))).)))..(((((((.(((......(((((..(((((....)))))))))).....))).))).))))...)))))))..((((((((((..((..((((..(((((((((..(((.(((((.(((((((((......((((((((((..((((((.(...(((.............)))...)))))))))))))))))(((....))).........((((...(((((.((((((...))))))))))).))))))))))))).))).))...)))..))).))))))..))))..))..))........(((.((((((.......))))))))).((((.(((((((((((((((((.((........(((((.(((((.((.(((.((((.((.(.....).)))))).))).))..((((((((....((((.((.((((((((((((.....((((((..........(((((((((...((((((((((((.(..((((.((((((.((((..........)))).))))))..))))..).))))).)))))))......)))))..)))).)))))).....(((((((...))))))).))))))))..)))).)).))))....))).)))))..((((((.((((((..(((..(((((((.((......)).)))))))..))).............(((((((.(...).)))))))((((.............................)))).(((((...((((............))))...))))).((((.............)))).....((((...)))).))))))...((((((((((..((.......)))))))))))).....))))))........)))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))))))).(((........))).....(((........)))((((((...)))))))))))))))))))))...)))))...)))))))....((.((((((((((((...(((....((((((.......))))))......))).))).)))..................))))))))..................)))....))).))))))))....(((((.((((((........((((((((........(((((..(((((....((((........(((((.....)))))........((((((((((..(((((.(((((......(((.....)))......))))).(((((......(((((((....((((((((.........))))))))....(((((.((.(((......)))..(((((.........)))))...)).)))))...((((((((((.((((....(((..(((.......)))..)))...)))).)).))))))))..((((((.....(((((((......))))))).....))))))...((((((.(....)))))))(((((((((((((((..(((.......)))..)))))))))))....)))))))))))....)))))..((((...(((((......)))))...)))).....((((.((........))))))......))))))))))))))).)))))))))..))))).....)))))))).)))))))))))))).)))).)).))).....)))))))))))))))))..))))(((((((..(((((................)))))..))))))).................)))))))))).........(((.(((((............((((((((..........)))))))).((((((((((((...)))))(((...(((((((((....)))))))))))).(((((((((......))))))))).(((((((.......)))))))))))))).........((((((((((........))))))))))..((((((((((((((((((........))))))......).))))))))))))))))))).(((((..((((......))))..)))))...))))))..(((.((((....)))))))....)))).))))).))....))))))))...)))))))..........((((((((........))))).))).))))))))))((((((((....)))))))).........((((....))))((((........))))...))))))))))................)))))))..........................)))))................((((((....(((((.(((...))).)).)))...))))))(((.(((((((((....))).((((.(((....)))..)))).(((((((..(.(((((...))))))..)).))....)))....)))))).)))..)))).)).)))))).).))..))))))).).)).)).))))))..)).)))).......((((((.........(((((((.......))))))).......))))))(((((((((.........))))))))))))))))))))...((((((((...((((((((((((...((((((.((((((..(((..(((((....)))))...)))......((((.....(((((.........)).))).....))))(((((((((((((((.(((((.(((............((((((..(((((....(.((((.......)))))...)))))..))....))))((((((.(((.((((.((((((.....)))))))))).((((.(((........))))))).........))))).))))......((((((((.((((((((.((.....(((.(((((..........((((........))))............)))))...)))...(((((((((.....(((..........)))..)))))))))..(((((....((.(((.((((((....((....))..))))))))))).(((((...........))))))))))..(((((((..............((((......))))...............))))))).....)))))))))).)))..))))).................................((((........)))).........(((....(.(((((((....))))))).)...)))...........))).))))).....))))))))))))))).))))))..))))))..)))))))))))).))))))))............(((((....))))).......))))))))))((((((........))))))....((((((.((((((((.(((...)))...)))))))).))))))..........(((.(((((.(((.......(((((((.((((((....))))))...............))))))).....))).))))).))).......(((((((((......)))))))))))))).......)))))).)))))...............(((((.....)))))))))))..))))))....))))...)))))))))))))((((((......)))))).......)))))..))...))))))))).(((((((((........)))))))))((...((((((..((.((.((((((((.......))).))))).)))).))))))....))...(((((...........))))).....((((((((.((.(((((((((((..((((......((((((......((....))......))))))((((((..((((....))))........)))))).((((((..(((((((((((((.(((..((((.........))))..))).....)))))))....))))))..)))))).........))))..)))..)).)))))).)).))))))))..))))))))))))).))...))))))))......))))))((((((((((((.(((.....((((((((((((((((...(((.....(((((.....))))).....))).)))))..))))......))))))))))))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,((((((,(((((({{{({{....(((((({{((((((((((((((.((..(((.({{(((.........))))).)))..)).))))).(((((.....)))))(((.(((....))).))).......))))),....(((((........))))))))))))))))...{{,.{.||((((((((((.((..((({.,(((.((.{..{(((,{{((.{((.....))))),}}))))}})))))))))..)).)))))))))))),),..(((((((((((((((....)))....)))).))))))))}}}))).)))((({..(((((((....))))))).,))))(((((..,(({{((....(((((((((,,,(((,((....{((((|,...)))})))))).)))))))))....))......((((((({,,,.,.||..((((((((((((((.((.((((((..{{{((((({...{{(,..{{|||..|.,)}},.},...,|||||{{.(((((....{(({.......,}}},..((({.({{((..((((...(((....))).)))).))),)).))))))))).)},...)),..)))))).}).)),})).))))))))){({|(({|.{((((........))))}..,,,.....((((.((((((((.{.(((({...(((,,....})),,,))))).}.))))))))))))...})))))),..((({(((((,..,{{...(({,{.{{,..,......,}}..,||||......)})}}}}},.}))))))((((......))))....)))}.))))|((((((.(({.{,.(((((((.(((((.......(((((...(((((((((({{{{...,({{{{.....,}}|,..,..,}}......|||}}...,,,..(((..((((((.((((((((((((..((.((((((.((...((((((...((((.(((((....({((((((,,,.((({{,,(((((((......))))))).....,|}}}}}..,|||..|||,...||||,,.}))))}}},,({{(((((((((((((((((,,.{((({{({{,...,,|.|{||...,,))}}..,|||,...((((((((.....(((((.(((((((((.(((.......))).))))......,((((((((..((((((((((((,(((((((({.,..,....}))}}.))}}.))},((((((...(((((.((..(.(((((((.{((((....(((((,,(((((.((({...})))))))))))))))))).}.)))))).).}..)).)))))...))))))....{{(((..((........))..)))))...,)))))).))))))}..)))))))).)))))))))))))..}}))..)))))))))).(((.........))).{((((((((((((.{((((.,({,.((((((((.(((.{(.((((,,,,.{,.(((((((((((..{(.........(((((((.(.....}.)))))))((((,....(((((({.......(((((({,(.(((.((((.((((.,..({((((,(((((((({.{(({{({..(((((((((..,(((((..((((.(({,(((.(((,(.((,(({(((((({{.,.(((((.((.((((.(.(((((.((((.((((((((.(.....).))))))..)).))))....((((((..{{{...}})....,)))))))),})).).)))).)).)))))..,)))).,..))))).}.|)),.}}},}})|}}.,||||.|(((...{||||...||||}...))).,,,.,,,..}}}}}}))).,)),.{{{((((((..(((((.....))))),}}|{((,((((,({{{{(,(,.{,...((((({((({,((((((((.(((....((((((((.(((...)))...))))))))..)))...})))).)))|},...}}||||,....,},.},||||||||||{||}|(((((..((((((((({....})))(((((....))))).....((((((.(((,(,,(((,......))))}))).))))))((((.,......)))).))))))..))))).}}}}}}||{((((((,,,,}||}}},...|.((((((......)))))),,,..{{{{,{({,{{{,,,,,....})},))))),))},)}),|||,|||.}}}}}}))}.,{(((({(((((,,(((....{{(......})),,,,)}}{{{{|||.,,)))),})))}(((({(,|....(((((((({.((((((((((((((((((((.,..(((((((,,(((((..((,,{((,...((((.,,......))))......)))}.))..))}})))))))))).,,.(((((.(({....|)).))))).,,....}.))))))))}..............((((.{{{......}}})))).(((.(((......))))))...(((((((((......((((((((..((..((...))..))....))))))))).)))))))))..{,,{{{{.,.....}.)))}..,}}..{((.{.{(((((..(((((({....})))))))))))).}.)))....((,{(((.......))))})...,|,........,.)))))))))))........|(({...{{{{,,.....}))}.,,.)}{{{.((((((...(((..(((((....))))).))).))))))..))).)))))))))...,}.)))))))))))}})})))},))))|||||{{{........(((........)))}}}}||||...((((......)))).,.)))),))))}),},)))),))))...))).})))))))..)))))))...,.)))).....}}..)))))).))}}}.....{{{,((((((,,{,.,,.|||||,..{{{|||(((||,.}}},{||||,,...{(((({((((((((,........,.))))))..,{(({{...{{{(((,(({{,.........{{{{{.|{{.{{..,{(((,,((({{{{|||||,|{,|||},{{,|||||||,||||},,{{{{,{{{{||.,,{(((((({...}))))))}.||{{{{||,|{{{{|||||,,.)))))))))).)))))}},...|,,)))))|{..,,,,,}}}}}),,,)))))}..),,))),)}}}},,,,,|}}}}}})))))|))})}|{{{({{,{{{.,|{{(,|||||||}|||{{{,{((({||,|||,{,,.|,}||||||||{{,,.,......,,.((((,{((((((((((,.((((((((((((...(((((.....(..(((((.{{{..,....,)))))))}..}}})}}.((((.({({(..,,))}},|.))})|.})))))))))))...{(((((.(((.....))))))))}...|((((((.((((((((((((....))))))))...((((((((((.((((({....}))))).))}..(((((((.(((.,....(((({..(((((....)))))}))))...,.))).))).))))...))))))).......))))..))).))))))))))))))).))))..||(((.((((((({{......((((((((((..((((((.(.,.(((.............))),.}.)))))))))))))))){{{....)}}......|||((((...(((((.((((((...))))))))))).))))))))))))).))),}|..{{{{......,},,,))))}))})),............(((.((((((.......)))))))))..,}.}}.}))}}},}||{(,..((((.({......)).))))..))}},..)))),.)).)))..)))))))).,}}.))))}((((((((....((((.((.((((((((((((.....((((((..........(((((((((.{.((((((((((((.{..((((.((((((.((((..........)))).})))))..))))..}.)))))))))))))..,...)))))..)))).)))))).,{{{{,,,|||,,.)}},))}.))))))))..)))).)).))))....))).)))))..))))))))))))}..,,,.,(((({{{.,,,,,...}}})))))))}).,,...........,.(((((((.(...).))))))).)))))..))))..))))))....)).))).))).)).)))).)))))))).((((.,{...(((((..{((((((((((..((({((((((((((((..{((((...|,,,.,..}))}}.((((((((((..((.....},,,))))))))))..(({{..,,))),..........)))))))))))).......{(((((((((,||..(((((...(((((((...((((((((.((((..{{{.,.((((((...)))))){(((((..,{({,..,,...,||..,,,,..,....{|||{.....}}}))...,,)))))}((((((,,,,,,.}}}))),,,...,...{((.,(({.(((((((...((((((((((({.(((.((....,...........|||{{{{((((,(({{{..,,(((.(((((((((.,((((.....{((......}}}...)))}..}}}}},.)}}}})}.....||||}....,|||{,....}}}}}.,,|||||}|||||{{(((((......,,,.....}},......))))).,|||.,....,)))))}}}}}.((((((((.........)))))))).,,|,.,,}}},.|||}}}}},}},..(((((.........)))))...)).))).)})))))))))))))))))),.,}},,)))......})),.)))).))))))))....))))))),))))).,,)))))))))}.....}))}.))))))))))}))))).,}.))))))))))..))){((((((((((((((((..(({,......)))..)))))))))))....)))))}{{{((({..{{{(.....))),.,||{{.....,|||||,.{,,........}}|.}}}}}}}..,,,}},})))))),...........))))))))))))).)))))...{(((................)))}...........))))).)))))))}}}((((((..((((((((.((,,.....,...,..,{{((((((.....{(((((..,(({,(,,(((,{((.(.((.((((.((({...}))).)))).)).).)))))).,}})},},))))))..)))))).}}((({{(({((((((((((({...})))),{{...(((((((((....)))))))))}},.(((((((((......))))))))).,((((((.......))))))}})))))}.......,{((((((((((........))))))))}}.|{(((((((((({((((((........))))))......,.))))))))))},,.,,,...,((((..((((......))))..))))},,,{{{{{{{{(((.((((....))))))}......|||||},||......,,....}}}},{{{((((.........(((((((((.(((....|,(((((.{{{{{|||||||((((((((....))))))))}...,,...||||..}}))))||.........{(((|{{.{{({{.{{({{.....{{{{{.....{{................................,)}......))})).....}}}}}}...))))),.))))))},,..(((((...{((((..((((((((.((((.........)))).)))..(((.((((((...(((((((..(((,,.....||.,{(({.,,...,|,}...,,}}},..),}...))),)}}.)))))))...)))))).)))))))).))))).....)))))..))))))))))))..........(((((((.......)))))))...})))))},,.(((((((((.........)))))))))..((((((.(((.{((((((((...((((((((((((...{(((((.((((((..(((..(((((....)))))...)))......((((.....{(({...........},}}},,,..))))(((((((((((((((.(((((.(({........{{{((((((.(((((.,..,,(,((((.......}}}}......,...,(({....{{((((({{.{({.((((.((((((.....))))))}})).||,{|(((........)))))||{(((((..,({{(({((((......((((...................))))....)))).........{((({{{{....|||,...,,..,,...}}}})}}.,,,...{((((((((...,,(((......,...))}..)))))))))}})))}}.})))),||{,((((((....((....))..)))))))}}...{{{{,..........,)))))),.))....}))}.))))).))))))..|||{.,,,,.||}}...........{{{{,|{{,.,,{({{|{((({..((((({....(((,.........................})}).))))))..))))..,|||......))},,...,,},|(((((,....})))))}..}},}}}.......,...})).))))).....))))))))))))))).))))))..)))))}..)))))))))))).))))))))................,.))).)))))){((((((((.{....}.))))))))}....|||.{{{..((((((.((((((((.(((...)))...)))))))).))))))...))),},..,,.{.{{(,{{.......,||)}},..((((((....)))))).}}}})}}},,,,,|,||,,|,.....}}}.,,)))..,}}}},,{{,((((((({.....,)))))))))),,}}..,,)))))))).)))))).,.............,((((.....))))))),))))))}}}||{{{{((({..{{|||{||,||.,,,{{{{||,,.,,}}},,,..,,...,||..,{{|{..||||}||,..{((((((((........))))))))))})},},,}}}}}}}..}}{||},}}}.)).}}}))),,))))||||{,{((((((({......(((((...........)))))((((.((((((((.((.((((((,((((..{{,({{{{.{((((((.....,({....))......))))))|,||{|}},|,|},|,||||...,..,.||,}}},((((({..(((((((((((({..,{,{((({...{{,...}))).,))}.,,..))))))}...,))))))..))))))..,{{,...,}}}..)))).}}.)))))).)).))))))))))))..................))))))))}....)))))}((((((((((((.(((,....((((((((((((((({,{{(,{.....(((((.....))))).....}))}))))}.,))))......))))))))))))))))))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AUUUCACAGGCCUGCCUUCUCUCACUAACGCUCUUCCUAGUCCCCGGGC… 7941 nt 0.4701
AUUUCACAGGCCUGCCUUCUCUCACUAACGCUCUUCCUAGUCCCCGGGC… 3334 nt 0.5435
AUUUCACAGGCCUGCCUUCUCUCACUAACGCUCUUCCUAGUCCCCGGGC… 3328 nt 0.5436
AUUUCACAGGCCUGCCUUCUCUCACUAACGCUCUUCCUAGUCCCCGGGC… 7950 nt 0.4699
AUUUCACAGGCCUGCCUUCUCUCACUAACGCUCUUCCUAGUCCCCGGGC… 3337 nt 0.5430
Summary

This gene encodes a member of a family of proteins that are structurally related to snake venom disintegrins and have been implicated in a variety of biological processes involving cell-cell and cell-matrix interactions, including fertilization, muscle development, and neurogenesis. Expression of this gene has been used as a maternal serum marker for pre-natal development. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. Shorter isoforms are secreted, while longer isoforms are membrane-bound form. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ADAM12 gene was downregulated during short-term weight loss in subcutaneous adipose tissue [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245]. Research in zebrafish identified the ADAM12 transcript as a development and cancer-related gene, with its abundance increasing within 0.1 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].