Basic Information

Symbol
CFAP91
RNA class
mRNA
Alias
Cilia And Flagella Associated Protein 91 AAT-1 AAT1 AMY-1-Associating Protein Expressed In Testis 1 AAT1alpha SPATA26 CaM-IP2 C3orf15 MAATS1 MYCBP/AMY-1-Associated Testis-Expressed Protein 1 MYCBP/AMY-1-Associated, Testis Expressed 1 Cilia- And Flagella-Associated Protein 91 MYCBP Associated And Testis Expressed 1 MYCBP-Associated, Testis Expressed 1 Spermatogenesis Associated 26 MYCBP-Binding Protein Protein MAATS1 Chromosome 3 Open Reading Frame 15 AAT1-Alpha SPGF51
Location (GRCh38)
3:119703022-119767102
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033364.4
Sequence length
4433.0 nt
GC content
0.4117

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1156.72 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1254.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1320.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320316.2 NCBI
GUUACCAUAGCGACGUGCACGCAGUAGCCAGGCCUGACCCGCUGGUCCC… 4482 nt 0.4148
NM_001320317.2 NCBI
GUUACCAUAGCGACGUGCACGCAGUAGCCAGGCCUGACCCGCUGGUCCC… 4356 nt 0.4114
NM_001320318.2 NCBI
GUUACCAUAGCGACGUGCACGCAGUAGCCAGGCCUGACCCGCUGGUCCC… 4198 nt 0.4100
NM_033364.4 NCBI
GUUACCAUAGCGACGUGCACGCAGUAGCCAGGCCUGACCCGCUGGUCCC… 4433 nt 0.4117
Summary

Involved in axonemal central apparatus assembly and spermatogenesis. Predicted to be located in motile cilium and radial spoke stalk. Implicated in spermatogenic failure 51. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats identified the CFAP91 as a member of a brain gene co-expression module associated with voluntary alcohol consumption, where its expression was negatively correlated with alcohol intake [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698].