Basic Information

Symbol
CFL1
RNA class
mRNA
Alias
Cofilin 1 CFL Cofilin 1 (Non-Muscle) 18 KDa Phosphoprotein Cofilin-1 P18 Epididymis Secretory Protein Li 15 Cofilin, Non-Muscle Isoform HEL-S-15 Cofilin
Location (GRCh38)
11:65823022-65862026
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005507.3
Sequence length
1245.0 nt
GC content
0.5550

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-449.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -472.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 268.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((((((((((((((.((....))...)))))))).....((((((((((((((((....))))))....(((((..((((..((.(((((..((((((((((...(((((....)))))...))))............))))))..)))))...))..))))..).))))((((.((((((((((.....))).).)))))).)))).....))).))))))).((((..((.((((((.((((.(((((((((((((((.(............((((.(((...(((.(((...((((((...((......))))).)))...)))...)))..))).)))).(((..((((((((((((((((...........((((.....((((((((.((((((((.(((..........((((((((((((((..((((....((((..(((.((((((.....(((.....)))........((((.(.(((((((...((..((((((.(((((((......))))))).))))))))...)))).))).)..))))...)))))).)))..))))))))..)))...))))))...)))))..........))).)))))))).)))))))))))).......))))).((((.((((.(((((((.((.((((.(((((((((.....))))).)))).)))).......))))))))))))))))))))))))))))..)))....).))))))).))))))))...............((((....))))...(((((.(((...))).))))).......(((((.(((((....)))))..))))).....................)))).)))))).))..))))..........))))))...........(((.(((.....))))))...........(((((((......))))))).....(((((.((.((..((.......))..)).)).)))))........((((((.(.(((.((...)).))).)))))))...))))))..)))))..........................((((...(((.(((.(((((.......(((((((.....((((((...((((..((((..((((((......))))))..))))..))))..)).))))...))))))).......)))))))))))...))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((((((((((((((((({((.((...,||,,,|||||}}|,,,{.{{{({(({{{{(((((....)))))}.,{{(((,{..,,,,}}||}|{{,({{((,,,.}}}}}.|(((({....|}|}|{{{{|,,|,,..,})}}}})))))},,))})}}},})}.}))),.)}}))){(((.((((((((((.....))).),}))))).}}}}....{{{.((((((...((((..((.((((((.((((.(((((((((((((((.{........{,..,((({(((..,..,..,|..}}|}}||...}|.,....|,.{{{,||{..,,,...,,,}})..,},||{({(..((((((((((((((((,..........((((.....((((((((,((((((((.(((..........((((((((((((((..(((,...{((((..(((.((((((.....(((.....)))..{,....{(((.(.{((((((...((..((((((.(((((((......))))))).))))))))...)))))),).}..)))}..,)))))).)))..))))))))..)))...))))))...)))))..........))).)))))))).))))))))))))......,))))),((((.((((.(((((((.((.((((.(((((((((....,))))).)))).)))).......)))))))))))))))))}))))))))))..)))....,.)))))))}}))))))}.......(((((({.{{((....}}},,,.,..)),|.}))))))..||.|{{{{{{{(((((.{{{{,,,,.,))))}}))})).....................)))).)))))).))..))))))))))))}.))))))...........((,,(((.,...}}}}}}..,,,.||.,,|{{{{{{......)))))},...{.(((((.((.{(,.,({......))..)).)).)))))}...,,,.((((((.{.(((.(,...)}.))).)))))))...))))))..})))}..........................((({,,.{{{.(((.(((((.......(((((((.....((((((...((((..((((,,((((((......)))))).,)))),.))))..)).))))...))))))).......))))))))}))..,))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005507.3 NCBI
GUUCAGUCGGGUCCCGGCAGCGGCUGCAGCGCUCUCGUCUUCUGCGGCU… 1245 nt 0.5550
Summary

The protein encoded by this gene can polymerize and depolymerize F-actin and G-actin in a pH-dependent manner. Increased phosphorylation of this protein by LIM kinase aids in Rho-induced reorganization of the actin cytoskeleton. Cofilin is a widely distributed intracellular actin-modulating protein that binds and depolymerizes filamentous F-actin and inhibits the polymerization of monomeric G-actin in a pH-dependent manner. It is involved in the translocation of actin-cofilin complex from cytoplasm to nucleus.[supplied by OMIM, Apr 2004]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.