Basic Information

Symbol
ADAM17
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase Domain 17 CSVP CD156B TACE Disintegrin And Metalloproteinase Domain-Containing Protein 17 Tumor Necrosis Factor, Alpha, Converting Enzyme A Disintegrin And Metalloproteinase 17 Cartilage Snake Venom-Like Protease TNF-Alpha Convertase Enzyme Snake Venom-Like Protease TNF-Alpha Convertase EC 3.4.24.86 ADAM Metallopeptidase Domain 18 TNF-Alpha Converting Enzyme TNF-Alpha-Converting Enzyme CD156b Antigen ADAM 17 ADAM18 NISBD1 NISBD
Location (GRCh38)
2:9488486-9556732
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003183.6
Sequence length
4391.0 nt
GC content
0.4209

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1244.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1334.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 994.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001382777.1 NCBI
AGCGGCGGCCGGAAGCUGGCUGAGCCGGCCUUUGGUAACGCCACCUGCA… 4411 nt 0.4201
NM_001382778.1 NCBI
AGCGGCGGCCGGAAGCUGGCUGAGCCGGCCUUUGGUAACGCCACCUGCA… 4416 nt 0.4198
NM_003183.6 NCBI
AGCGGCGGCCGGAAGCUGGCUGAGCCGGCCUUUGGUAACGCCACCUGCA… 4391 nt 0.4209
Summary

This gene encodes a member of the ADAM (a disintegrin and metalloprotease domain) family. Members of this family are membrane-anchored proteins structurally related to snake venom disintegrins, and have been implicated in a variety of biologic processes involving cell-cell and cell-matrix interactions, including fertilization, muscle development, and neurogenesis. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protease. The encoded protease functions in the ectodomain shedding of tumor necrosis factor-alpha, in which soluble tumor necrosis factor-alpha is released from the membrane-bound precursor. This protease also functions in the processing of numerous other substrates, including cell adhesion proteins, cytokine and growth factor receptors and epidermal growth factor (EGF) receptor ligands, and plays a prominent role in the activation of the Notch signaling pathway. Elevated expression of this gene has been observed in specific cell types derived from psoriasis, rheumatoid arthritis, multiple sclerosis and Crohn's disease patients, suggesting that the encoded protein may play a role in autoimmune disease. Additionally, this protease may play a role in viral infection through its cleavage of ACE2, the cellular receptor for SARS-CoV and SARS-CoV-2. [provided by RefSeq, Aug 2020]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue identified the ADAM17 as a predicted target of miR-152, which is up-regulated in the frontal cortex of alcoholics [Warden & Mayfield 10.1016/J.Neuropharm.2017.02.017].