Basic Information

Symbol
CGB5
RNA class
mRNA
Alias
Chorionic Gonadotropin Subunit Beta 5 HCG Chorionic Gonadotropin, Beta Polypeptide 5 Chorionic Gonadotropin Beta Subunit 5 CGB Chorionic Gonadotropin Beta 5 Subunit Choriogonadotropin Subunit Beta 3 Chorionic Gonadotropin Chain Beta Choriogonadotropin Subunit Beta CG-Beta HCGB
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_033043.2
Sequence length
877.0 nt
GC content
0.6522

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-351.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -365.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((....((((.((((....((((((...)))))).........(((((.(((.((................)).))).)))))..(((((((....(((..........)))...)))))))..((((((((......)))))))).(((........))))))))))).(((.((((((((((((((((.((((....))))...(((((((..((((((.((((((.((((((((....((((..(((((.(((..(((((......))).))............((((((...))))))..)))))))))).))....)))..))))).)))))))))))).)))....)))).(((.....)))(((((((..((.((((((.((.((.(((..((.(((.((((.(((((.(((.((((((.((.((((((.((((..((.........)))))).)))))).))....((((((((.....(((((((((.(.((..((((((((....((((((((.....((((..((..((....))..))..)))).....))))))...))....))))))))......)).).)))))))))....))))).))))))))).))).))))).(((((((((((((....))).))..))))))))(((...)))))))..))).))))).)).)).))))))...(((...(((((((((.(((((......))))).........)))))))))...))).............))..)))))))..)))))))))))..((((......))))..(((((.(....)...))))).))))).)))..))))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((,...||}}{((((...(((({..((((((...)))))).........{((((.(((.((,...............)).))).))))|{{((|,,,({{{{(((.,.,,.....|,.}}})}})))...((((((((......)))))))){(((........))))))))}...(((.((((((((((((((((.((((....))))...(((((((..(((((,{((((((.((((((((...,({((..(((((.(((..{{(((......))).}}............((((((...))))))..)))))))))).))....)))..))))).)))))))))))).)))}...,))),(((,...,))){((((((..((.(({(((,((.((.({(|,{(,(((,((({{(((((.(((.((((((.((.((((((.((((.,{,.........)})))).)))))).))....((((((((.....(((((((((.(.((..((((((((....(,((((((....{((((..((,,{{...,)),.}}..})))}}...))))))...},....)))))))),.....)).).)))))))))....))))).))))))))).))).))))),((((((((({(((....))).}}..))))))))(({...)))}}}}..}}},)}}}},)).)).)))))).},,|{,..(((((((((.(((((......))))).........)))))))))...,||({.......}}}},,..))))))}..)))))))))))..((((......))))..(((((.{...,}...))))).))))).))).....))))).....}}}}}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCACUUUGCUCGGGUCACGGCCUCCUCCUGGCUCCCAGGACCCCACCA… 877 nt 0.6522
Summary

This gene is a member of the glycoprotein hormone beta chain family and encodes the beta 5 subunit of chorionic gonadotropin (CG). Glycoprotein hormones are heterodimers consisting of a common alpha subunit and an unique beta subunit which confers biological specificity. CG is produced by the trophoblastic cells of the placenta and stimulates the ovaries to synthesize the steroids that are essential for the maintenance of pregnancy. The beta subunit of CG is encoded by 6 genes which are arranged in tandem and inverted pairs on chromosome 19q13.3 and contiguous with the luteinizing hormone beta subunit gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.