Basic Information
Symbol
CH25H
RNA class
mRNA
Alias
Cholesterol 25-Hydroxylase
Cholesterol 25-Monooxygenase
EC 1.14.99.38
H25OH
C25H
Location (GRCh38)
10:89205629-89207317
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_003956.4
Sequence length
1689.0 nt
GC content
0.4831
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-528.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-559.83 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
409.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| CUCAGCUGCCUUGCACAGCCUCGCAAUGAGCUGCCACAACUGCUCCGAC… | 1689 nt | 0.4831 |
Summary
This is an intronless gene that is involved in cholesterol and lipid metabolism. The encoded protein is a membrane protein and contains clusters of histidine residues essential for catalytic activity. Unlike most other sterol hydroxylases, this enzyme is a member of a small family of enzymes that utilize diiron cofactors to catalyze the hydroxylation of hydrophobic substrates. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans identified a molecular signature of chronic cocaine abuse in postmortem midbrain dopamine neurons, where the CH25H transcript was upregulated 1.8-fold and was diagnostic for assigning subjects to the cocaine-abusing cohort with significant accuracy [Bannon et al. DOI:10.1038/Npp.2014.70].