Basic Information

Symbol
CHCHD4
RNA class
mRNA
Alias
Coiled-Coil-Helix-Coiled-Coil-Helix Domain Containing 4 MIA40 TIMM40 Mitochondrial Intermembrane Space Import And Assembly Protein 40 Coiled-Coil-Helix-Coiled-Coil-Helix Domain-Containing Protein 4 FLJ31709 Mitochondrial Intermembrane Space Import And Assembly 40 Homolog (S. Cerevisiae) Translocase Of Inner Mitochondrial Membrane 40 Homolog (S. Cerevisiae) Translocase Of Inner Mitochondrial Membrane 40 Homolog
Location (GRCh38)
3:14112077-14124876
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001098502.2
Sequence length
1433.0 nt
GC content
0.4822

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-467.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -492.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098502.2 NCBI
AGUUUCCGGCUGAGGUUGGCCUGGCCGCGGUUGCGAGGGCGCCGAGGCA… 1433 nt 0.4822
NM_144636.3 NCBI
AGUUUCCGGCUGAGGUUGGCCUGGCCGCGGUUGCGAGGGCGCCGAGGCA… 1603 nt 0.4885
Summary

CHCHD4, a component of human mitochondria, belongs to a protein family whose members share 6 highly conserved cysteine residues constituting a -CXC-CX(9)C-CX(9)C- motif in the C terminus (Hofmann et al., 2005 [PubMed 16185709]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the CHCHD4 as a hub gene in the cyan module of the platelet transcriptome from patients with non-ST-segment elevation myocardial infarction (NSTEMI), where it was associated with functions related to extracellular space and calcium binding [Zhang et al. DOI:PMC8129354].