Basic Information

Symbol
ADAM22
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase Domain 22 MDC2 Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, And Cysteine-Rich Protein 2 Disintegrin And Metalloproteinase Domain-Containing Protein 22 A Disintegrin And Metalloproteinase Domain 22 Metalloproteinase-Disintegrin ADAM22-3 ADAM 22 EIEE61 DEE61
Location (GRCh38)
7:87934136-88202889
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001324418.2
Sequence length
9508.0 nt
GC content
0.4040

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2657.59 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2842.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2264.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001391980.1 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 9277 nt 0.4042
NM_001391981.1 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 9205 nt 0.4043
NM_001391982.1 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 9202 nt 0.4046
NM_004194.5 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 2883 nt 0.4683
NM_016351.6 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 9226 nt 0.4044
NM_021721.5 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 2775 nt 0.4692
NM_021722.6 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 9313 nt 0.4038
NM_021723.5 NCBI
ACUCGCUCGCUCCCCCCGCCAGCGGAAGCGUCCGCGAAGCACAAUGCAG… 9334 nt 0.4049
Showing 11 to 18 of 18 entries
Summary

This gene encodes a member of the ADAM (a disintegrin and metalloprotease domain) family. Members of this family are membrane-anchored proteins structurally related to snake venom disintegrins, and have been implicated in a variety of biological processes involving cell-cell and cell-matrix interactions, including fertilization, muscle development, and neurogenesis. Unlike other members of the ADAM protein family, the protein encoded by this gene lacks metalloprotease activity since it has no zinc-binding motif. This gene is highly expressed in the brain and may function as an integrin ligand in the brain. In mice, it has been shown to be essential for correct myelination in the peripheral nervous system. Alternative splicing results in several transcript variants.[provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ADAM22 was part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes in brain reward circuitry, identified through RNA-Seq analysis of selectively bred lines with differential risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].