Basic Information

Symbol
CHCHD6
RNA class
mRNA
Alias
Coiled-Coil-Helix-Coiled-Coil-Helix Domain Containing 6 CHCM1 PPP1R23 MICOS25 Mic25 Mitochondrial Contact Site And Cristae Organizing System Subunit 25 Coiled-Coil-Helix Cristae Morphology Protein 1 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 23 MICOS Complex Subunit MIC25 MGC13016 Coiled-Coil-Helix-Coiled-Coil-Helix Domain-Containing Protein 6, Mitochondrial Coiled-Coil-Helix-Coiled-Coil-Helix Domain-Containing Protein 6 Coiled-Coil-Helix Cristae Morphology 1 Coiled Coil Helix Cristae Morphology 1 MIC25
Location (GRCh38)
3:126704214-126960420
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032343.3
Sequence length
1000.0 nt
GC content
0.5920

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-398.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -417.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((...(((((((((((((((((..((..(((((.((((((((((..(((((.((((((((((.(((((((.(.(......).).)....))))))))))))))))((((........))))..((((((((..((((((((((.((((((((...((((((((......((((....)))).....)))...)))))...)))))..((((((......(((((((((((((.((((((.......)))))).))).............(((((((((((.......)).))))).))))...(((.(((((..........))))))))..))))))).)))..))))))))).)).)))).))))..)))))))).(((((((.................)))))))..((.(((((..((.((((((.((((((((((..((..(.(((....))))..)).....)).)))))..))).))))))))))))).)).....))))).))).)))).))).))).))..))....)))))))))))(((((((.....((((.....(((((((((....)).))).)))).....))))....((((((((((.((((((.(..(.(......((((....))))))..)))))))((((((((.(((((((((((..((((..........))))..((.(.((((.(((((((.((((((..(((...)))..)))))).))))))).)))).).)).((((....))))..(((.((((..........)))))))((((((((.((((..((((.....)))).))))))))(((..(((((...))))))))))))........)))))))..)))).....)))))))).))))))))))((.(((((...)))))..)))))))))...(.(((((((((((....((....)).))))))))))).)))))))......)).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,{{((((({(((((((((((,,((..(((((.((((((((((..(((((.((((((((((.((((((,.{,,......,......,.))))))))))))))))((((........))))..((((((((..((((((((((.((((((((...((((((((......((((....)))).,...))),..)))))...)))))..((((((....,,{{{(((((({(((,{(((((.......)))))}.))}.,{,.....}...(((((((((((.......)).)))))}})))...{{,{(((((..,.......))))))}},.))))))).)},..))))))))).)).)))).))))..)))))))).(((((((.................)))))))..((.((((,.,((.(((((({(,,(((((((..{(.,(.(({....}))}..)).....)).)))))..,)).))))))))))))).)).....))))).))),}))).))).))).))..))....)))))))))))(((((((.....((((...,,(((((((({....}}.)))}}))},,,..)))),,,.((((((((((.((((((.{..(.,......((((....)))))}.,)))))))(((((((({(((((((((((..{{{.{(,,(({.,,|||.,(((.{.((((.(((((((.((((((..(((...)))..)))))).))))))).)))).),}|,((((....))))..(((.((((..........)))))))})}|)))|,||||,,|{{|,.,,,)|||.}}}}.||,(((..(((((...))))))))}},,...,,,..))))))}.,))))...},)))))))).)))))))))).|,|(((,...})))}..,,)))))))..,(.(((((((((({....((....)).))))))))))).)},,,.,...},})),,,,.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320610.2 NCBI
AAAGCGUUGUUGGCCCGGUUGCUCUGGAGCCGGGUCUCGGGUCUGGUGG… 1003 nt 0.5922
NM_032343.3 NCBI
AAAGCGUUGUUGGCCCGGUUGCUCUGGAGCCGGGUCUCGGGUCUGGUGG… 1000 nt 0.5920
Summary

Involved in DNA damage response and cristae formation. Located in cytosol and mitochondrial inner membrane. Part of MICOS complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the CHCHD6 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].