Basic Information

Symbol
CHIC2
RNA class
mRNA
Alias
Cysteine Rich Hydrophobic Domain 2 BTL Cysteine-Rich Hydrophobic Domain-Containing Protein 2 Cysteine-Rich Hydrophobic Domain 2 Protein Cysteine-Rich Hydrophobic Domain 2 BRX-Like Translocated In Leukemia Cystein-Rich Hydrophobic Domain 2 BrX-Like Translocated In Leukemia
Location (GRCh38)
4:53994803-54064605
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012110.4
Sequence length
1109.0 nt
GC content
0.4743

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-353.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -375.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 448.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012110.4 NCBI
GGUUUCCUGAGUUGCUGCUGCUGCGGCGGCGGCAGCGGCGUCUGUGCUU… 1109 nt 0.4743
Summary

This gene encodes a member of the CHIC family of proteins. The encoded protein contains a cysteine-rich hydrophobic (CHIC) motif, and is localized to vesicular structures and the plasma membrane. This gene is associated with some cases of acute myeloid leukemia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the CHIC2 as a differentially expressed gene that was upregulated in animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].