Basic Information

Symbol
CHID1
RNA class
mRNA
Alias
Chitinase Domain Containing 1 SI-CLP Stabilin-1 Interacting Chitinase-Like Protein Chitinase Domain-Containing Protein 1 FLJ42707 MGC3234 Stabilin-1-Interacting Chitinase-Like Protein GL008 SICLP
Location (GRCh38)
11:867331-915579
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_023947.4
Sequence length
3260.0 nt
GC content
0.6113

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1421.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1471.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1126.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142674.2 NCBI
GUGCGUUUGUGGCCGUCCGGCCUCCCUGACAUGCAGAUUUCCACCCAGA… 3364 nt 0.6109
NM_001142675.2 NCBI
AGAGCCGCCGCGACCCCACCCAGGAGCACUGGCCAGCCUGGGGAAGACA… 3325 nt 0.6126
NM_001142676.2 NCBI
GUGCGUUUGUGGCCGUCCGGCCUCCCUGACAUGCAGCCCUCUGGACCCC… 3335 nt 0.6111
NM_001142677.2 NCBI
GUGCGUUUGUGGCCGUCCGGCCUCCCUGACAUGCAGCCCUCUGGACCCC… 3167 nt 0.6085
NM_023947.4 NCBI
GUGCGUUUGUGGCCGUCCGGCCUCCCUGACAUGCAGCCCUCUGGACCCC… 3260 nt 0.6113
Summary

Enables oligosaccharide binding activity. Involved in negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response. Located in several cellular components, including late endosome; lysosome; and trans-Golgi network. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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