Basic Information

Symbol
CHN1
RNA class
mRNA
Alias
Chimerin 1 N-Chimerin ARHGAP2 RhoGAP2 CHN Rho GTPase-Activating Protein 2 Chimerin (Chimaerin) 1 Alpha-Chimerin Chimaerin 1 N-Chimaerin A-Chimaerin DURS2 NC Chimerin 1 (GTPase-Activating Protein, Rho, 2) Duane Retraction Syndrome 2 A2-Chimaerin
Location (GRCh38)
2:174798809-175005381
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001822.7
Sequence length
3156.0 nt
GC content
0.4575

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-954.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1019.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 793.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001025201.4 NCBI
GUGGGAGACGCUAUCGCAAGAUGGCGUCUGCGAGGCCGCGGGAUGCGGA… 2449 nt 0.4630
NM_001206602.2 NCBI
GCAGGCAGUAUGUAGGCAUCUUUCAUUCAGAAUGGACAUUAAUAUCUUG… 2232 nt 0.3934
NM_001371513.1 NCBI
GUGGGAGACGCUAUCGCAAGAUGGCGUCUGCGAGGCCGCGGGAUGCGGA… 2527 nt 0.4586
NM_001371514.1 NCBI
CGGUCCCCCGCGUCCCGGCCUGCAGCCUCCCCGGGCGCCGGCGCCCCCA… 2402 nt 0.4405
NM_001822.7 NCBI
GUGGGAGACGCUAUCGCAAGAUGGCGUCUGCGAGGCCGCGGGAUGCGGA… 3156 nt 0.4575
Summary

This gene encodes GTPase-activating protein for ras-related p21-rac and a phorbol ester receptor. It is predominantly expressed in neurons, and plays an important role in neuronal signal-transduction mechanisms. Mutations in this gene are associated with Duane's retraction syndrome 2 (DURS2). Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2011]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation, which synthesizes findings from numerous cited investigations, identifies the CHN1 as a transcriptomic feature positively associated with aging in whole blood samples from a cohort of healthy people [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].