Basic Information

Symbol
CHP1
RNA class
mRNA
Alias
Calcineurin Like EF-Hand Protein 1 CHP SLC9A1BP Sid470p P22 P24 EF-Hand Calcium-Binding Domain-Containing Protein P22 Calcineurin B Homologous Protein 1 Calcineurin Homologous Protein Calcium-Binding Protein CHP Calcium-Binding Protein P22 Calcineurin B-Like Protein Calcium Binding Protein P22 SLC9A1 Binding Protein Calcineurin B Homolog SPAX9
Location (GRCh38)
15:41230824-41281888
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007236.5
Sequence length
3201.0 nt
GC content
0.4599

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-959.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1025.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 923.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007236.5 NCBI
AGUGGAAACACUGCCCUCUCCCUUCUUGACCCCUAGCCCUUCCUUCCCU… 3201 nt 0.4599
Summary

This gene encodes a phosphoprotein that binds to the Na+/H+ exchanger NHE1. This protein serves as an essential cofactor which supports the physiological activity of NHE family members and may play a role in the mitogenic regulation of NHE1. The protein shares similarity with calcineurin B and calmodulin and it is also known to be an endogenous inhibitor of calcineurin activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that a 7-day overfeeding intervention in lean and obese men induced differential expression of 45 genes in abdominal subcutaneous adipose tissue, with the CHP1 being up-regulated in response to the positive energy challenge [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970].