Basic Information

Symbol
ADAM28
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase Domain 28 EMDCII ADAM23 Epididymal Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, And Cysteine-Rich Protein II Disintegrin And Metalloproteinase Domain-Containing Protein 28 ADAM 28 EMDC II MDC-Lm MDC-Ls MDC-L MDCL Epididymial Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, And Cysteine-Rich Protein II Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, And Cysteine-Rich Protein-L Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, And Cysteine-Rich Protein L A Disintegrin And Metalloproteinase Domain 28 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein EC 3.4.24.- EC 3.4.24
Location (GRCh38)
8:24294016-24359014
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Postmortem interval inference Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014265.6
Sequence length
7019.0 nt
GC content
0.3820

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1767.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1901.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1853.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001304351.2 NCBI
ACUGGAGAGGAGGCAGGGACAGACCCAGCAGCACCCACCUGAGCGAGAA… 6956 nt 0.3815
NM_014265.6 NCBI
ACUGGAGAGGAGGCAGGGACAGACCCAGCAGCACCCACCUGAGCGAGAA… 7019 nt 0.3820
NM_021777.5 NCBI
ACUGGAGAGGAGGCAGGGACAGACCCAGCAGCACCCACCUGAGCGAGAA… 2106 nt 0.4174
Summary

This gene encodes a member of the ADAM (a disintegrin and metalloprotease domain) family. Members of this family are membrane-anchored proteins structurally related to snake venom disintegrins, and have been implicated in a variety of biological processes involving cell-cell and cell-matrix interactions, including fertilization, muscle development, and neurogenesis. The protein encoded by this gene is a lymphocyte-expressed ADAM protein. This gene is present in a gene cluster with other members of the ADAM family on chromosome 8. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

A study in humans identified the ADAM28 as a top biomarker for burn recovery, showing sustained decreasing expression in leukocytes from the healthy state through the late recovery phase (>400 hours post-injury) [Xu et al. DOI:10.1159/000493451]. In zebrafish, research demonstrated that the ADAM28 transcript, categorized as a cancer-related gene, increased in relative abundance postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267]. A study in mice selectively bred for high or low methamphetamine intake identified the ADAM28 as part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes in brain reward circuitry, specifically within the ventral midbrain, nucleus accumbens, and prefrontal cortex [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].