Basic Information

Symbol
CHRM1
RNA class
mRNA
Alias
Cholinergic Receptor Muscarinic 1 Acetylcholine Receptor, Muscarinic 1 Muscarinic Acetylcholine Receptor M1 HM1 M1R M1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_000738.3
Sequence length
2646.0 nt
GC content
0.6134

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1121.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1161.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 853.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...(.(((((((((((.((...(((...)))..))))))))))......((((.(((((((...((((..((((((((..(((..(((......((((((((.(((((((((((.............)))))))))))..((.((......)).))..(((....)))(((((((((..(((((..((((((..........))))))..((.((((...((((...))))((((..((((.((((((................)))))).))))...))))...)))).))(((((((.(..(((((.((((((((...(((((((((......)))))))))...)))).))))....)))))..).))))))).......(((((.(.(((..............)))))))))(((((((((((((.((((.((((.((........)))))).................((((((.....((((.(((((((((.(..((((((((((.((((((.((((((((........).))))))).........((((((.....(..(((((.......)))..))..).....))))))((((((.(((((((.(((((....(((.......))).((((.(((.((.((...((((((((((.(..(((((((.(((.(((((((((....((((........))))......(((.(((((((((((.((((((.((...))))))))...))).)))))))).)))))))((((((((.(((((...(((((.((((.(((.....((((((((((((....)))).))......((((((..((...(((...........)))(((......)))((.(((((....)))))))))..)))))).....(((((((((((((((((((((.....(((.((((((((...)))))))).))).((.(((....)))..))..))))))...)))))))))..))))))(((((......))))).................(((((.((((.....(((((....)))))))))...)))))..)))))))))))))))))))))))))))))))..))).))))).)).))))).).)))).))))))..)).))))).)))).))))))))))..............)).)))))).......)))).)).).)))))))))...).)))).))))).))))....))))))((((((((((((((.((.((((.((.(((((.((((..((.((((.(((((...))))))))).)))))))))))............((((((((((((.........)))).))))))))......)).))))..)).))))((.(((((((((((((((((....))))))(((((........))))).......)))))((((...))))(((((......((((((((((.((((((((((((((..(((..((((.((((((.((((.((.((((((((...........)))))..))))).((((...))))(((((((((((..(((((...((((.....((((.((((.(((.(((..(((.((((......))))(((((((..(((((((((((......))))(((((((.((((...(((((......)))))..)))).)))))))....(((.(((((...))))).))).)))))))..))))))).....(((.(((((((((((((((((((((.((((....)))).))))))..))))))))...)))))))))).(((((.....))))).)))..))).))))))).))))....))))((((..((((((....)))))).....))))..))))).))))))..))).))..(((.(((((....))))).))))))).)))))).))))..)))...)))).)))))).))))...))))))))))...(((((........)))))((((((........)))).))....(((((.((((....)))).)))))....)))))((((((((....))))((((((...((((((.(((((...........)))))..)))))).)))))).))))....((((..(((..((((...((....))..)))).)).)..))))))))))))))))))))))................)))))))).))))).))))((((((((......(((((..............(((((((((.(((((.((....((((.(((.....))).)))).......)).))).))))))).))))...))))).......))))))))..........(((((.(((((((((.....))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))((((.(((........((..(((...(((..(((((......)))))..)))..)))..)).......))).)))).....)))...))).))))))))))))))))))))))).((((.((((...(((((.((((((....))))))...))))).))))..))))...))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((...,.(((((((((((,{{...(((...)))..})))))))))......((((.(((((((...((((..((((((((..(((..(((.....{(((((({({(((((((((({..,,,,,,.....|||||||}}}},.((,{{...,,.}},}),}|||}.|.,))||||(((({.,(((((..((((((..........))))))..||.{|||...|{{...,})))||||},|{{(.((((((.,{..........,,,||}}}}.))))...)))}..,})))..|(((((((.{..(((((.((((((((...(((((((((......)))))))))...)))).))))....)))))..}.))))))}.,..(({((((,.(,((({........,,,..||||||,||({(((((((((((.((({.,,,{,(({,,.{{{{{{..|,.............}},.|((((({.{{{((,,.,||||||||}|}.(((((((({{,((,{{{.((((((((........).)))))))...({{,,{(((,{{..,{{({{((({.{{{{{,{{({{((((.{{({{.,{||,,((((((.(((((((.({(((,...{{|,......}||,((((.(((,((.{{...(((({{(({({(|,((,,,((.,{{.{{{{{|||{.,,,|||{,,,.,,..||||,....{(((.(((((((((((.((((((.((...))))))))...))).)))))))).))))},,{((((((,,(((((...(((((.((((.(({{({.((((((((({,(({{,.||||{.{{.....{{||||,.|{...{{|.....,,....}}),{{.,,|..}||((.(((((....)))))}),},.})))}),}...((((((((((((((({(((((.....(((.((((((((...)))))))).))).((.(((....)))..))..))))))},.)))))))))..)))))){{|||,..,,,))||}.,.,|,}}.}}}.....(((((.((((.....(((((....)))))))))...))))).)))),}))))))))))))))))))))))))))..,},,)))),.)),})},},}.}))).))))))..)),))))).)))}.))))))))))..........,...)).))))))}..,},,,}))}),,,}))))))))}..})})))),.}|||,||||,,,|}|||||||(((|,(((((({....})).))))(((({,((((..((.((({{(((((...))))))))).)))))))))))............((((((((((((.........)))).)))))))){{{{.,,.,}}),..{{({{((((.{...,.,|||||||{(({{{.||||||((({{..,.....|||||.......,,,},||||,..}}}}..,||......||{{{{||||,|||{{{{{|||{||,|||{,,||{|,||{|||.{{{{.||,|{,|||((,,{....,|..}}))},.|}}||,((((...)))){{(((((((((..((({{..,{,,{,||{|{,,({{{.,,{((,{((..,...,.(({{{.{{{.||(((((((..(((((((((((......))))(((((((.((((...(((((......)))))..)))).)))))))....(((,(((((...))))).))).)))))))..)))))))..,..,||},|||||,|((((((({(((((.((((....)))).}))))}.,))))))))}}}))))}))))|,{((((.....))))),})).,)))))).)))}}}}}|||||}|{{{,|||||{(({{...,))))))},))),}))))))))),))}|||,,|||.|,..(((.(((((....))))).))))))),)))})),)})},.}}}.,.}))),))}})}.)|||{|||,,}}))))),}.{{{{{.....,..))))),|||||}}},...}))})}}),.,,(((((.((((....)))}.))))),,}|{|||}|||,(((({{({((({((({((...{{{{{{.{((({...........)))))..}))))},))})))))))}....((({.,({,..((((...((....))..)))).)}.}..)))),|||}}}|||||||}||},....,,,}}})}}..}||||||||.}}||.}}}}((((((((.|....(((((..............{((((((((.(((((.((....({((,,{({,...,)),,))).......)).))).))))))).)))}...))))).....,.)))))))}...,,,....(((((.(((((((((.....))))))))).)))))}}))).}}})))))))))))))}||||}}|||...,.,,)))},})},,||{..|((((......)))))},))),,,,,..,,.......,,.}})))}}}}.)))...))).))))))))))))))))))))))).((((.((((...(((((.((((((....))))))...))))).))))..))))...))).})))}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AUGCCAAUCACUGGCUGUGCCUCUCCCGCUGCCAGCACAGGGCGCAGCU… 2646 nt 0.6134
Summary

The muscarinic cholinergic receptors belong to a larger family of G protein-coupled receptors. The functional diversity of these receptors is defined by the binding of acetylcholine and includes cellular responses such as adenylate cyclase inhibition, phosphoinositide degeneration, and potassium channel mediation. Muscarinic receptors influence many effects of acetylcholine in the central and peripheral nervous system. The muscarinic cholinergic receptor 1 is involved in mediation of vagally-induced bronchoconstriction and in the acid secretion of the gastrointestinal tract. The gene encoding this receptor is localized to 11q13. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.