Basic Information

Symbol
CHRM2
RNA class
mRNA
Alias
Cholinergic Receptor Muscarinic 2 Acetylcholine Receptor, Muscarinic 2 Muscarinic Acetylcholine Receptor M2 Muscarinic M2 Receptor 7TM Receptor HM2
Location (GRCh38)
7:136868652-137020255
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001006630.2
Sequence length
5971.0 nt
GC content
0.3979

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1514.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1639.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1361.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000739.3 NCBI
ACAGACUAGCCAAGUGGCUGAGACGAGUGUGGGGUGCGUGACUCUGCCU… 5719 nt 0.3936
NM_001006626.3 NCBI
ACAGACUAGCCAAGUGGCUGAGACGAGUGUGGGGUGCGUGACUCUGCCU… 5797 nt 0.3950
NM_001006627.3 NCBI
AUUGCAGCUAAUCGAACACACACGCACGAAUACAGACACGCUCUCCUGC… 5893 nt 0.3971
NM_001006628.3 NCBI
CUUUUCUUUUGCAAGAUCAAGGGAGAAAGAGAACCGGCAGCUGGCCUCG… 5645 nt 0.3888
NM_001006629.3 NCBI
CUUUUCUUUUGCAAGAUCAAGGGAGAAAGAGAACCGGCAGCUGGCCUCG… 5567 nt 0.3878
NM_001006630.2 NCBI
AUUGCAGCUAAUCGAACACACACGCACGAAUACAGACACGCUCUCCUGC… 5971 nt 0.3979
NM_001006631.3 NCBI
ACAGACUAGCCAAGUGGCUGAGACGAGUGUGGGAUCAAGGGAGAAAGAG… 5663 nt 0.3901
NM_001006632.3 NCBI
ACAGACUAGCCAAGUGGCUGAGACGAGUGUGGGGUGCGUGACUCUGCCU… 5641 nt 0.3927
NM_001378972.1 NCBI
AUUGCAGCUAAUCGAACACACACGCACGAAUACAGACACGCUCUCCUGC… 6083 nt 0.3982
NM_001378973.1 NCBI
ACAGACUAGCCAAGUGGCUGAGACGAGUGUGGGAUCAAGGGAGAAAGAG… 5585 nt 0.3891
Summary

The muscarinic cholinergic receptors belong to a larger family of G protein-coupled receptors. The functional diversity of these receptors is defined by the binding of acetylcholine to these receptors and includes cellular responses such as adenylate cyclase inhibition, phosphoinositide degeneration, and potassium channel mediation. Muscarinic receptors influence many effects of acetylcholine in the central and peripheral nervous system. The muscarinic cholinergic receptor 2 is involved in mediation of bradycardia and a decrease in cardiac contractility. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A review of RNA-Seq studies in post-mortem human brains reported that the CHRM2 was identified as a differentially expressed gene in the anterior cingulate cortex of subjects with bipolar disorder, belonging to class A of the G protein-coupled receptor family [Wu et al. DOI:10.1111/Pcn.12550].