Basic Information

Symbol
CHRM3
RNA class
mRNA
Alias
Cholinergic Receptor Muscarinic 3 M3AChR Acetylcholine Receptor, Muscarinic 3 Muscarinic Acetylcholine Receptor M3 M3 Muscarinic Receptor EGBRS HM3 PBS
Location (GRCh38)
1:239386513-239915452
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001375978.1
Sequence length
9179.0 nt
GC content
0.4418

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2751.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2926.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2648.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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GGGCAAUGGCGGGCGCCCCUCCCCCAGCCUCGUUGCCGCCUUGCAGUUU… 8778 nt 0.4311
NM_001347716.2 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9408 nt 0.4410
NM_001375978.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9179 nt 0.4418
NM_001375979.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9116 nt 0.4422
NM_001375980.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9017 nt 0.4414
NM_001375981.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9080 nt 0.4410
NM_001375982.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9183 nt 0.4418
NM_001375983.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9220 nt 0.4418
NM_001375984.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9184 nt 0.4405
NM_001375985.1 NCBI
ACACCAGCUCUCUCAGUCCGGGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGAACGCGAG… 9121 nt 0.4410
Summary

The muscarinic cholinergic receptors belong to a larger family of G protein-coupled receptors. The functional diversity of these receptors is defined by the binding of acetylcholine and includes cellular responses such as adenylate cyclase inhibition, phosphoinositide degeneration, and potassium channel mediation. Muscarinic receptors influence many effects of acetylcholine in the central and peripheral nervous system. The muscarinic cholinergic receptor 3 controls smooth muscle contraction and its stimulation causes secretion of glandular tissue. Alternative promoter use and alternative splicing results in multiple transcript variants that have different tissue specificities. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that chronic ethanol self-administration broadly altered the brain transcriptome, with the CHRM3 identified as a positively correlated gene associated with synaptic signaling in the central nucleus of the amygdala [Iancu et al. DOI:10.1111/Adb.12501]. Cross-species molecular analyses confirmed that synaptic genes, including the CHRM3, are consistently perturbed in gene networks associated with excessive ethanol consumption across mice and non-human primates [Farris et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2017.11.036].