Basic Information
Symbol
CHRNB3
RNA class
mRNA
Alias
Cholinergic Receptor Nicotinic Beta 3 Subunit
Acetylcholine Receptor, Nicotinic, Beta 3 (Neuronal)
Cholinergic Receptor, Nicotinic, Beta Polypeptide 3
Cholinergic Receptor, Nicotinic, Beta 3 (Neuronal)
Neuronal Acetylcholine Receptor Subunit Beta-3
Cholinergic Receptor, Nicotinic Beta 3
Acetylcholine Receptor, Neuronal Nicotinic, Beta-3 Subunit
Location (GRCh38)
8:42697366-42737407
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_000749.5
Sequence length
2347.0 nt
GC content
0.4542
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-668.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-715.15 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
735.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GAGAAGCGGCACACUCGGCGAGAGGGGUUGAGAUUGUUUUAUUCCACUC… | 2347 nt | 0.4542 | |
| GAGAAGCGGCACACUCGGCGAGAGGGGUUGAGAUUGUUUUAUUCCACUC… | 2480 nt | 0.4593 |
Summary
The nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs) are members of a superfamily of ligand-gated ion channels that mediate fast signal transmission at synapses. The nAChRs are (hetero)pentamers composed of homologous subunits. The subunits that make up the muscle and neuronal forms of nAChRs are encoded by separate genes and have different primary structure. There are several subtypes of neuronal nAChRs that vary based on which homologous subunits are arranged around the central channel. They are classified as alpha-subunits if, like muscle alpha-1 (MIM 100690), they have a pair of adjacent cysteines as part of the presumed acetylcholine binding site. Subunits lacking these cysteine residues are classified as beta-subunits (Groot Kormelink and Luyten, 1997 [PubMed 9009220]). Elliott et al. (1996) [PubMed 8906617] stated that the proposed structure for each subunit is a conserved N-terminal extracellular domain followed by 3 conserved transmembrane domains, a variable cytoplasmic loop, a fourth conserved transmembrane domain, and a short C-terminal extracellular region.[supplied by OMIM, Apr 2010]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.