Basic Information

Symbol
CHST2
RNA class
mRNA
Alias
Carbohydrate Sulfotransferase 2 C6ST Galactose/N-Acetylglucosamine/N-Acetylglucosamine 6-O-Sulfotransferase 2 Carbohydrate (N-Acetylglucosamine-6-O) Sulfotransferase 2 N-Acetylglucosamine 6-O-Sulfotransferase 1 GlcNAc6ST-1 Gn6ST-1 GST-2 Carbohydrate (Chondroitin 6/Keratan) Sulfotransferase 2 Epididymis Secretory Protein Li 75 EC 2.8.2.- HEL-S-75 GN6ST GST2
Location (GRCh38)
3:143119771-143124014
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004267.5
Sequence length
4142.0 nt
GC content
0.5739

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1760.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1832.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 803.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004267.5 NCBI
GCAGAGGCUGGUCCGAGCGCGUUGCGGGCGCCCGGCGUAAGGGGAGUCG… 4142 nt 0.5739
Summary

This locus encodes a sulfotransferase protein. The encoded enzyme catalyzes the sulfation of a nonreducing N-acetylglucosamine residue, and may play a role in biosynthesis of 6-sulfosialyl Lewis X antigen. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

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