Basic Information

Symbol
ADAMTS3
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase With Thrombospondin Type 1 Motif 3 KIAA0366 ADAMTS-4 A Disintegrin-Like And Metalloprotease (Reprolysin Type) With Thrombospondin Type 1 Motif, 3 A Disintegrin And Metalloproteinase With Thrombospondin Motifs 3 Procollagen II Amino Propeptide-Processing Enzyme Procollagen II N-Proteinase ADAM-TS 3 ADAM-TS3 ADAMTS-3 PC II-NP Zinc Metalloendopeptidase EC 3.4.24.14 EC 3.4.24.- EC 3.4.24 HKLLS3
Location (GRCh38)
4:72280969-72569221
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014243.3
Sequence length
6244.0 nt
GC content
0.4212

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1737.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1859.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1442.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014243.3 NCBI
CUCUUUCUCCCGCUCCCGCUCGCUCGUCUCUCUCGCUAAUACUUCCCCC… 6244 nt 0.4212
Summary

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protease. This protease, a member of the procollagen aminopropeptidase subfamily of proteins, may play a role in the processing of type II fibrillar collagen in articular cartilage. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

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