Basic Information

Symbol
CHST8
RNA class
mRNA
Alias
Carbohydrate Sulfotransferase 8 GALNAC4ST-1 Carbohydrate (N-Acetylgalactosamine 4-0) Sulfotransferase 8 N-Acetylgalactosamine-4-O-Sulfotransferase 1 GalNAc-4-O-Sulfotransferase 1 GALNAC-4-ST1 GalNAc-4-ST1 GalNAc4ST-1 GALNAC4ST1 EC 2.8.2.- GalNAc4ST PSS3
Location (GRCh38)
19:33621942-33773509
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001127895.2
Sequence length
2225.0 nt
GC content
0.6521

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1015.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1048.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 689.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127895.2 NCBI
ACUUCGCUGGGAGCCUUCCCGGCGCGCAAGCCGGAUCCGGCAGUGCUGC… 2225 nt 0.6521
NM_001127896.2 NCBI
ACUUCGCUGGGAGCCUUCCCGGCGCGCAAGCCGGAUCCGGCAGUGCUGC… 2148 nt 0.6639
NM_022467.3 NCBI
GGGACUCGUCCCAGAGUUUGCUGCCGCCGCCGCCGCUGCCAUUAGAGCG… 2496 nt 0.6366
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the sulfotransferase 2 family. It is predominantly expressed in the pituitary gland, and is localized to the golgi membrane. This protein catalyzes the transfer of sulfate to position 4 of non-reducing N-acetylgalactosamine (GalNAc) residues in both N-glycans and O-glycans. It is responsible for sulfation of GalNAc on luteinizing hormone (LH), which is required for production of the sex hormones. Mice lacking this enzyme, exhibit increased levels of circulating LH, and precocious sexual maturation of both male and female mice. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue demonstrated that the CHST8 mRNA was hypermethylated in the nucleus accumbens of subjects with alcohol use disorder compared to controls, with a mean methylation level of 0.532 in cases versus 0.246 in controls [Liu et al. DOI:10.3390/genes13060958].