Basic Information

Symbol
CIRBP
RNA class
mRNA
Alias
Cold Inducible RNA Binding Protein CIRP Cold-Inducible RNA-Binding Protein Glycine-Rich RNA Binding Protein A18 HnRNP Glycine-Rich RNA-Binding Protein CIRP Cold Inducible RNA-Binding Protein Testicular Tissue Protein Li 39 A18HNRNP
Location (GRCh38)
19:1259384-1274880
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001300829.2
Sequence length
3346.0 nt
GC content
0.5708

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1342.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1396.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1085.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001280.3 NCBI
CUCACUCGCGCGUUAGGAGGCUCGGGUCGUUGUGGUGCGCUGUCUUCCC… 1333 nt 0.5191
NM_001300815.2 NCBI
CUCACUCGCGCGUUAGGAGGCUCGGGUCGUUGUGGUGCGCUGUCUUCCC… 1091 nt 0.6269
NM_001300829.2 NCBI
CUCACUCGCGCGUUAGGAGGCUCGGGUCGUUGUGGUGCGCUGUCUUCCC… 3346 nt 0.5708
Summary

Enables mRNA 3'-UTR binding activity and small ribosomal subunit rRNA binding activity. Involved in mRNA stabilization; positive regulation of translation; and response to UV. Located in cytoplasm and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CIRBP was significantly highly expressed in the brain, lungs, and kidneys of a fatal hypothermia case compared to a trauma control, though expression was lower in myocardial cells, suggesting its potential as an auxiliary diagnostic indicator [Zheng et al. DOI:10.1016/J.Jflm.2024.102786]. Research in rats found that mRNA and protein expression of the CIRBP was significantly increased in specific brain regions, including the prefrontal cortex, due to fatal hypothermia, and its expression in the prefrontal cortex could distinguish hypothermia from asphyxia, though it could not differentiate hypothermia from conditions like starvation [Chen et al. DOI:10.1016/j.cryobiol.2025.105541].