Basic Information

Symbol
CISD1
RNA class
mRNA
Alias
CDGSH Iron Sulfur Domain 1 MitoNEET C10orf70 MDS029 ZCD1 CDGSH Iron-Sulfur Domain-Containing Protein 1 Cysteine Transaminase CISD1 Chromosome 10 Open Reading Frame 70 Zinc Finger, CDGSH-Type Domain 1 Zinc Finger CDGSH-Type Domain 1 EC 2.6.1.3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_018464.5
Sequence length
2375.0 nt
GC content
0.3381

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-555.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -605.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 504.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....(((((((.((((....))))((.((((((............)))))).))(((....))).((((((.((((.((...((((..(((((((....))).))))(((((((.(((.....))))))((((......)))).)))).((.(((((((.......))))))).))....))))...)).)))).)))))).......(((((.(..((((((((((((...(((((((((......((((((...............((((((......(((((....).)))).....)))))).(((((.((((.....(((.((....(((((((((..((((((...(((((((((((((((((((............................))))))))))...)))))..))))....).)))))...))))).))))....)).)))...)))))))))))))))...(((....((((((((....(((((((....((((((.....((((((.((((((((.(((((((((....(((((...)))))...))))))))).(((....)))(((((.(((((..(((.....))).))))).)))))...............((.....))((((((((.....))))))))...((((((((.(((((((((((((((((((.((((.(((.((((...(((((.....)))))..))))))))))).))))))...(((((..................)))))((((((((.......))))))))......(((...((((((((((((..((((((((((((((.(((((((((((.......((.(((....(((((((........)))))))....))).))((((...(((((((((.((((...)))).))...)))))))..))))............((((((((((((...))))))).))))).))))))))))).))))......))))))))))...)))))))))))).))).(((((..(((((....)))))..).)))))))))))))).))).)))).)))).......))))))))..))))))(((((((((((.....((.(((.....))).))..)))))))))))..(((((((((((..((((............))))..)).))))))))).((((..((...........(((((.....)))))..........))..))))))))))....)))))))...))))))))...))).(((((((((.......)))))))))....(((.....))).)))))))))....))).)))))))))..).))))).......((((((((...(((((.........)))))))))))))))))))).((((.....))))....(((((((((((((...................)))).....)))))))))...((((((((((..(((((((..........((((((((.......)))))))).....(((((((((((((......((......((((((((((((((((.............(((((....((((((((...........((((((((((((.(((....))))))((((..............)))).)))))))))...)))))).))......)))))..(((((((((((.(((((((((((((((((((....((((((..........))))))))))))))))).))))....((((((((..........((((..(((((....)))))..))))))))))))(((.((((.........)))).))).......(((((((((((.........))))...)))))))....(((((((.......)))))))................)))).)).))).))))))......((((((....))))))....((((...((((((.....))))))....))))....)))))).)))))).))))....)))))))))))))))...))))))).....)))))))))).....(((((.((....(((((((((.((((((.(.((.((((((.((....))))))))....))...).)))))).)))))))))...)))))))))..((((((((((((.(((......))).(((((.((((((((((((((......(((..........)))))))))....)))))))))))))...........(((((........))))))))))))))))).......((((.(((((....))))).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{....(((((((.((((....))))((.((((((............)))))).))(((,..,|||,({(((({((((,{{..|{((,..((({{{{...,))}.})))|...{{(.{{(...,,||}||}{{|{...,,,))))))))),||,|((((({.,,,,,{||}||||.},}})},)))},,)),,}}),,)))},.....,.{((((.(..((((((((((((...(((((((((......((((((...............((((((,{....(((((....).))))....,)))))).((({{(((((..,..(((.((....(((((((((..((((((...(((((((((((((((((((..........,........,}.......))))))))))...))))),.))))....),)))))...))))).))))....)).)))...)))))))))))))))...,(({{{{,,,{||||,,..(((((((....((((((....,((((((.((((((((.(((((((((....(((({...}))))...))))))))).(((....)))(((((.(((((..(((.....))).))))).)))))...............((.....)){(((((((.....)))))))},,.((((((((.(((((((((((((((((.,,,.(((.(((..((.(((((({...(((((((((((,.,,,((((.(((....))).)))).....)))}}}......})))))..}}}}}))).))..))).))),}.)))))},..((((((((((((.,((((((((((((((.(((((((((((,{,..,,((,(((....(((((((........)))))))....}}}}))|||(.,.{((((((({.{{{{,..,}}}.},.,))))))))..))}}..,}....,}},((((((((((({...})))))).))))).,)))))))))).))))......)))))))))).,.))))))))))))..,,.(((((..(((((....)))))..),}))),))))))))).))).)))).)))).,,,,..))))))))..))))))|((((((((((.....((.(((.....))).))..))))))))))}.,((({(((((||..((((...,........))))..}}.})))))}}},((((.,(({..,......,{||||,,,,}))))),......},,,,..))))))))))....)))))))...||||||},...|||.(((((((((.......))))))))),}}.{||,,,,.}}}.)))))))))....))).)))))))))..).))))}.}.....((((((((...(((((.........))))))))))))}))))))).{{{,.....}}}}..,.(((((((((((((...................)))),....|)}})))}|...((((((((((.,(((((((...,,,....||||..(({{{,...,,,,)}))}}}}.(((((((((((((......{{.,....((((((((({((((((,...,,,|,,...|||,{..,{{((((({,.....,,,{.,(({{{{{{|||,,|||....,,|||(((((..,........,,.))))}))))}}}}}...}}}}}}|{|.{{{{.......,|||{|{,{,((,(((,(((((((((((((((....((((((........,.))))))))))))))))).))))....{(((((((..........((((..(((((....))))),.)))))))))))}{{{,,{{{,,,,,,},,|||,.|||,,,....(((((((((((.........))))...)))))))....(((((((.......))))))).......,,,,...,})),,.}},}||.}}}}}),.....,(((({....)))))}....||||,..||||||,..,.,,}}},....)}}}....)))))).}))))).))))..},)})))))))))))))...))))))}...,.)))))))))).....{{||||{|||,.(((((((({.((((((.{,,{{(((((||((....))))))))....}}...}.)))))).)))))))))..,)))}))})}..((((((((((((.{((......}}},{(((({,.,(((((,,((((((....,,|}}}}}..})}))...,))))}}}||||||}|{|{|,,,...,,,,},|||{|,,,,,...}))}})))))))))))).......{(((.(((((....))))).))),.....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCAUCGCGGAGUCGGUGCUUUAGUACGCCGCUGGCACCUUUACUCUCG… 2375 nt 0.3381
Summary

This gene encodes a protein with a CDGSH iron-sulfur domain and has been shown to bind a redox-active [2Fe-2S] cluster. The encoded protein has been localized to the outer membrane of mitochondria and is thought to play a role in regulation of oxidation. Genes encoding similar proteins are located on chromosomes 4 and 17, and a pseudogene of this gene is located on chromosome 2. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that in skeletal muscle, the CISD1 protein expression was lower in heavier co-twins from BMI-discordant monozygotic twin pairs, indicating its association with acquired obesity and mitochondrial alterations [van der Kolk et al. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100226].