Basic Information

Symbol
CISD2
RNA class
mRNA
Alias
CDGSH Iron Sulfur Domain 2 Miner1 NAF-1 ERIS Endoplasmic Reticulum Intermembrane Small Protein Nutrient-Deprivation Autophagy Factor-1 ZCD2 CDGSH Iron-Sulfur Domain-Containing Protein 2 Zinc Finger, CDGSH-Type Domain 2 MitoNEET-Related 1 Protein WFS2 MitoNEET Related 1 Wolfram Syndrome 2 CDGSH2
Location (GRCh38)
4:102868971-102892807
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001008388.5
Sequence length
5878.0 nt
GC content
0.3714

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1630.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1748.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1531.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008388.5 NCBI
AGUGCCCGCCGGCCGCUUCCGCUCCCGGCGCAGGCGCGGCAGCUUGGCC… 5878 nt 0.3714
Summary

The protein encoded by this gene is a zinc finger protein that localizes to the endoplasmic reticulum. The encoded protein binds an iron/sulfur cluster and may be involved in calcium homeostasis. Defects in this gene are a cause of Wolfram syndrome 2. [provided by RefSeq, Mar 2011]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in human post-mortem blood demonstrated that the CISD2, a regulator of autophagy that antagonizes BECN1-mediated cellular autophagy, was included in a post-mortem interval (PMI) prediction model with a positive coefficient, indicating its up-regulated expression pattern contributed to the model which achieved a root mean square error of 4.75 hours [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].