Basic Information

Symbol
CISH
RNA class
mRNA
Alias
Cytokine Inducible SH2 Containing Protein CIS-1 SOCS CIS G18 Cytokine-Inducible SH2-Containing Protein Suppressor Of Cytokine Signaling Cytokine-Inducible Inhibitor Of Signaling Type 1B Cytokine Inducible SH2-Containing Protein Protein G18 BACTS2
Location (GRCh38)
3:50606456-50611774
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_145071.4
Sequence length
2019.0 nt
GC content
0.5864

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-789.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -823.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 665.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_013324.7 NCBI
AGUCCCUGUCCUGCGCCCGCGCGCCCCGGGAGCCUACCCAGCACGCGCU… 2176 nt 0.5846
NM_145071.4 NCBI
AGUCCCUGUCCUGCGCCCGCGCGCCCCGGGAGCCUACCCAGCACGCGCU… 2019 nt 0.5864
Summary

The protein encoded by this gene contains a SH2 domain and a SOCS box domain. The protein thus belongs to the cytokine-induced STAT inhibitor (CIS), also known as suppressor of cytokine signaling (SOCS) or STAT-induced STAT inhibitor (SSI), protein family. CIS family members are known to be cytokine-inducible negative regulators of cytokine signaling. The expression of this gene can be induced by IL2, IL3, GM-CSF and EPO in hematopoietic cells. Proteasome-mediated degradation of this protein has been shown to be involved in the inactivation of the erythropoietin receptor. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.