Basic Information

Symbol
CLASRP
RNA class
mRNA
Alias
CLK4 Associating Serine/Arginine Rich Protein SWAP2 CLK4-Associating Serine/Arginine Rich Protein SFRS16 CLASP Splicing Factor, Arginine/Serine-Rich 16 Clk4 Associating SR-Related Protein Splicing Factor, Arginine/Serine-Rich 16 (Suppressor-Of-White-Apricot Homolog, Drosophila) Suppressor Of White Apricot Homolog 2 Suppressor Of White-Apricot Homolog 2
Location (GRCh38)
19:45039045-45070956
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007056.3
Sequence length
2229.0 nt
GC content
0.6344

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-890.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -931.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 751.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((..((((((((((((((((((....))))....(((((((((..(((((....)))))(((((...))))).))))).))))...(((((.(((((((((...((..((((((.((((((((..........))))...........(((((((((((((.(((((((....(((.....)))........(((.((..(((((((.(((((..(((((((....((((((((((((.((..((((.((.(((.(((..((((((....((((((.....((((...((((((((((..............(((((.....)))))(((((........)))))....................)))))))).))....)))).......))))))..)))).))..)))..(((....)))..))))).))))..)).)))))......))))))).((((((((....)))..))))).(((((..(((......)))..)..))))(((((((((.......(((((.................))))).......).)))))))).)))))))))))).).))))..))..))))).(((((((((......(((......)))(((((((((((((.........((((((((((((....((((((..((((.((......))..))))..)))((((((((((.(((.(((..(((((..(((((..(((((................)))))(((((..(((.(((((((.(((((((.(...(((.(.((((..........)))).)(((....)))..((((...((....)).))))(((.((....(((..(((.(((((......((((((..((....))..))))))..((((...(((((.((.((((((....))))..)))).)).)))...))))))))))))))))).)))......)))....).))))))).))))...))))))..)))))..)))))..(((((((..((((....))))..))).))))........))))))))))))))..((((((..(..((.((.(((..((...((.(((((....))))).))....)).))).)).))..)..))))))..)))))))...((((((((((((((...))))..))..)))))).))))).....))).))))))))))))))))))))))))))))))).((....)).))))))))))).)))).))))).)))).))))))..))((((((((.((..((....)).))..)))))))).(((....)))(((((((((((...((((((..(((((.(((.((((........))))(((.((..(....((((((((((.((.(((..((((...((((.(((............)))))))...))))(((.(((.(((((..(((..((((((.((..(((((((.(.((((......))))).)))....((((((((((.((((((...(((((.......)).)))((.((....)).)).))))))...).)))))))))........))))..)))).))))..))).))))))))))).((((....((((((((.(..(.(((.((((..(((..(((..(((((........))....)))..))).....))))))).))).)..).))))).))).....))))......)))))...))))))))))...)..)).)))((((((.........(((.((((((((............)))))).)))))...((..(((((.....)))))..)).........)))))).................))).)))))..)))))))))))))))))...))))))))).)))))))))))).....((((........))))....)))).)))..))))))))).((.((((((.(((((((((.(((((.(((((.((.((((.(((((.....(..(((((((........)))))))..)........((((...((((.(..((((((((.((.......))......)))))))).).))))))))..))))).)))).)).)))))..)))).).)).)))))))(((((.((....)).)))))................)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((({.(((((.,((((((((((((((((((....)))}.{{{(((((({((((({,{{.{{{|{{{((((({...|||||||}}}}.||||...|{{{{.{{{(((({(...{{..({((((.{(({{{{{,,{....|||))},.........{.(((((((((((((.(((((((....{({.....}}}....{{.,{,.{{{..(({((((.(((({..(((((((,,,.((((((((((((.((.,((((.((.(((,(((..((((((...,((((((.....((((...{(((((((((............,|{{{{,.....}}}}}(({{(,,....,.)))})..,,,,...,..........)))})))).},....)))).......)))))).,)))).))..))).,{({,...,,,,.))))).))))}.)).)))))}.....,)))))).(({{((((...,)}}..}}))),((((,..(((......)))..,..))))(((((((({.......(((((.................))))).......}.}))))))).)))))))))))).}.))))..}}..||}}||(((((((((,..{{,(({......))){((((((((((((....,,.,.(((({(({{{{{..},|||{{(..((((.((.,..,.}},.}}}}..}}}(({(((({{{|{{{|||{.,{{,.,,.(((((.,(((((.,...,.........,||||}(,({,..|{{.|||||{{,((|||,,}|}}},||.|,((((..........}}}|{|(((....||}.,,..{||||||..{{((({{{{{,|||,,..|||,.|||.{{(((,..,,,((((((..((....))..)))))}..((({.,.,({(((((.((((({....}}}}.|))}.|,}}))}.,,}}|,))))))},}}}.,.}}}.{((((.{{...,).))))).},}}}||||},.}}},.))))}..)))))..(((((((..((((....))))..))).))))..,.,,,.}}))))).},,))),,||||||..{..{|.|{.{({..{|.,.||,||{(({{,.}}})),))....}}.}}}.)).},,,|..}})))),,)}))))),..{{{{((((({{{{{...}))).,||..,})}}),))}})}})}}))))))))))))))))))))))))))))))))))}.||.}}.)).))))))))))).)))).)))))}|))},}}))))..||.{{(((|(|((||{{....|||||,||||||.|||(||....|||(((({{{{{(({..((((((,.(((((.(((.{(((,,......||{|,(({((,(({(,,(((((((({...,.((((((((,..{((,{.,{{....,}}..}}})))))}).},))))|||.{{{,|||||,}|||,,|||{||.|,,}|,|||||.|.{{||.....,))))}})},.|.,|||{||||||}|||||{...{((......}},}},))){|.||,}}.)).||||}}}}},,,))}}))}}})}.}},},.,)))).,)}}}.)))),.))).}}))}}}}))),|,||,.}.||||{,{{,{{.|,{{|.||{|,.{{{..(((..((({{........}}..,.)})..))).....))))))).))),},,},))))}}|||..{{{|||,.......{{{..{{(({({((,||......,}.,|.((((((...,{....(((.{{((((((............)))))).}})))..}}({{(((((.....))))}.,)))........))))))..........,,{.{{{,,,.))),)}},))))))))),,))),,...,,)))))),.)))}})))))))....,((((........))))}...)))).)))..)))))},)),||,{(((({.(((((((((.(((((.(((((.((.((((.(((((.,...{..(((((((........)))))))..}........((((...((((..,.((((((((.,{..,....,,..,...)))))))).).))))))))..))))).)))).)).)))))..)))).}.)).))))))){((((.{(....)).))))}................}))))},}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278439.2 NCBI
CUUUCAUUUCCGCUUCCGGUGCGGGCCGCGCGCGAGCGCAGCGGUGGGA… 2043 nt 0.6378
NM_007056.3 NCBI
CUUUCAUUUCCGCUUCCGGUGCGGGCCGCGCGCGAGCGCAGCGGUGGGA… 2229 nt 0.6344
Summary

Predicted to be involved in RNA splicing and mRNA processing. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.