Basic Information

Symbol
ADAMTS5
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase With Thrombospondin Type 1 Motif 5 ADAMTS11 ADMP-2 Aggrecanase-2 A Disintegrin-Like And Metalloprotease (Reprolysin Type) With Thrombospondin Type 1 Motif, 5 (Aggrecanase-2) A Disintegrin And Metalloproteinase With Thrombospondin Motifs 11 A Disintegrin And Metalloproteinase With Thrombospondin Motifs 5 ADAM-TS 11 ADAM-TS 5 ADAMTS-11 ADAM-TS5 ADAMTS-5 EC 3.4.24.14 EC 3.4.24.82 EC 3.4.24.- EC 3.4.24 ADMP2
Location (GRCh38)
21:26917922-26967088
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007038.5
Sequence length
9621.0 nt
GC content
0.4186

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2769.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2951.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2598.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007038.5 NCBI
ACAGCGCUCGCGCUGCUCUCGGCGCUCGCAGCUGCCGACUGGGGAUGAC… 9621 nt 0.4186
Summary

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature enzyme. This enzyme contains two C-terminal TS motifs and functions as an aggrecanase that cleaves aggrecan, a major proteoglycan of cartilage, and may mediate cartilage destruction in osteoarthritis. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation identified the ADAMTS5 as a top protein associated with aging in plasma SOMAscan analysis [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].