Basic Information

Symbol
ADAMTS6
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase With Thrombospondin Type 1 Motif 6 ADAM-TS6 A Disintegrin And Metalloproteinase With Thrombospondin Motifs 6 A Disintegrin-Like And Metalloprotease (Reprolysin Type) With Thrombospondin Type 1 Motif, 6 ADAM-TS 6 ADAMTS-6 EC 3.4.24.82 EC 3.4.24.-
Location (GRCh38)
5:65148738-65481920
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_197941.4
Sequence length
7309.0 nt
GC content
0.4254

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2073.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2218.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2027.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_197941.4 NCBI
AGUGUGCUCUGCCUCCGAGGAAAAGCUGCCAAAAUUUUCUCCUGCUGCA… 7309 nt 0.4254
Summary

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature enzyme. Expression of this gene may be regulated by the cytokine TNF-alpha. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

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