Basic Information

Symbol
CLIC6
RNA class
mRNA
Alias
Chloride Intracellular Channel 6 CLIC1L Chloride Intracellular Channel Protein 6 Glutaredoxin-Like Oxidoreductase CLIC6 Parchorin CLIC5 Chloride Channel Form A EC 1.8.-.-
Location (GRCh38)
21:34668994-34718227
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_053277.3
Sequence length
4197.0 nt
GC content
0.5606

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1595.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1669.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1211.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317009.2 NCBI
AACCCCAGGACAGCGGACAGCGGGCCGGGCACUUCCAAAGGCGCAGGAG… 4251 nt 0.5582
NM_053277.3 NCBI
AACCCCAGGACAGCGGACAGCGGGCCGGGCACUUCCAAAGGCGCAGGAG… 4197 nt 0.5606
Summary

This gene encodes a member of the chloride intracellular channel family of proteins. The gene is part of a large triplicated region found on chromosomes 1, 6, and 21. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

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