Basic Information

Symbol
CLMP
RNA class
mRNA
Alias
CXADR Like Cell Adhesion Molecule ASAM ACAM Coxsackie- And Adenovirus Receptor-Like Membrane Protein CXADR Like Membrane Protein CAR-Like Membrane Protein Adipocyte-Specific Adhesion Molecule Adipocyte Adhesion Molecule CXADR-Like Membrane Protein FLJ22415 CSBM CSBS
Location (GRCh38)
11:123069853-123196697
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024769.5
Sequence length
5032.0 nt
GC content
0.4461

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1584.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1674.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1300.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_024769.5 NCBI
ACUCCUUUUUCUUUCCAAACAGGGAAAAGUGUUCCACGAAGCGGUAGCG… 5032 nt 0.4461
Summary

This gene encodes a type I transmembrane protein that is localized to junctional complexes between endothelial and epithelial cells and may have a role in cell-cell adhesion. Expression of this gene in white adipose tissue is implicated in adipocyte maturation and development of obesity. This gene is also essential for normal intestinal development and mutations in the gene are associated with congenital short bowel syndrome. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

A study in human myocardial samples from explanted hearts demonstrated that the CLMP mRNA expression was significantly upregulated in dilated cardiomyopathy (8.16-fold, p < 0.0002) and ischemic cardiomyopathy (4.33-fold, p < 0.002) compared to a healthy control group [Tatrai et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2011.05.010].