Basic Information

Symbol
CLTC
RNA class
mRNA
Alias
Clathrin Heavy Chain CLTCL2 Hc Clathrin Heavy Chain On Chromosome 17 Clathrin, Heavy Polypeptide-Like 2 Clathrin, Heavy Polypeptide (Hc) Clathrin Heavy Chain 1 CLH-17 Clathrin, Heavy Chain (Hc) Clathrin, Heavy Chain KIAA0034 CHC17 MRD56 CLH17 CHC
Location (GRCh38)
17:59619680-59696956
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004859.4
Sequence length
8369.0 nt
GC content
0.4147

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2323.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2491.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2059.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001288653.2 NCBI
AGCCGUUUCCGGAGUCUGCGCUGCGCCCGGUUCCGCCAUUGCGGCUCUC… 8381 nt 0.4144
NM_004859.4 NCBI
AGCCGUUUCCGGAGUCUGCGCUGCGCCCGGUUCCGCCAUUGCGGCUCUC… 8369 nt 0.4147
Summary

Clathrin is a major protein component of the cytoplasmic face of intracellular organelles, called coated vesicles and coated pits. These specialized organelles are involved in the intracellular trafficking of receptors and endocytosis of a variety of macromolecules. The basic subunit of the clathrin coat is composed of three heavy chains and three light chains. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A review of forensic literature notes that in human and pig bloodstains, the CLTC is a final degradation product of methemoglobin whose formation increases over time, a process utilized for time since deposition estimation [Weber et al. DOI:10.1016/j.forc.2020.100248].