Basic Information

Symbol
CMBL
RNA class
mRNA
Alias
Carboxymethylenebutenolidase Homolog Carboxymethylenebutenolidase Homolog (Pseudomonas) Carboxymethylenebutenolidase-Like (Pseudomonas) FLJ23617 EC 3.1.-.- JS-1
Location (GRCh38)
5:10275875-10307974
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138809.4
Sequence length
3893.0 nt
GC content
0.4816

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1298.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1372.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 926.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138809.4 NCBI
CUCUCGUCUCCUCCCCACUGCGCCUCCCUCCCUCCUGGCCUUCCUUCCC… 3893 nt 0.4816
Summary

CMBL (EC 3.1.1.45) is a cysteine hydrolase of the dienelactone hydrolase family that is highly expressed in liver cytosol. CMBL preferentially cleaves cyclic esters, and it activates medoxomil-ester prodrugs in which the medoxomil moiety is linked to an oxygen atom (Ishizuka et al., 2010 [PubMed 20177059]).[supplied by OMIM, Apr 2010]

Forensic Context

A study in humans identified the CMBL as an mRNA biomarker for sepsis, where it was found to be upregulated in the peripheral whole blood of sepsis patients compared to healthy controls using RNA-sequencing [Qin et al. DOI:10.1097/JCMA.0000000000000209].