Basic Information

Symbol
CMPK2
RNA class
mRNA
Alias
Cytidine/Uridine Monophosphate Kinase 2 Nucleoside-Diphosphate Kinase UMP-CMPK2 TYKi NDK Cytidine Monophosphate (UMP-CMP) Kinase 2, Mitochondrial UMP-CMP Kinase 2, Mitochondrial Cytidylate Kinase 2 UMP/CMP Kinase Thymidylate Kinase Family LPS-Inducible Member Thymidine Monophosphate Kinase 2 Mitochondrial UMP-CMP Kinase EC 2.7.4.14 EC 2.7.4.6 IBGC10 TMPK2
Location (GRCh38)
2:6840570-6866635
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_207315.4
Sequence length
3095.0 nt
GC content
0.5137

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1137.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1195.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 756.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256477.1 NCBI
AACGCUUCGCUUUCGUUUCCCGCUGGCGCCUGGCUCCCUCCGGGUUUCG… 2176 nt 0.5593
NM_001256478.1 NCBI
AACGCUUCGCUUUCGUUUCCCGCUGGCGCCUGGCUCCCUCCGGGUUUCG… 1241 nt 0.6608
NM_207315.4 NCBI
ACAUCUCGCGGCGAGGAGGAGAGGCCGGAAGGGCGCCCCAGCCCCAGGG… 3095 nt 0.5137
Summary

This gene encodes one of the enzymes in the nucleotide synthesis salvage pathway that may participate in terminal differentiation of monocytic cells. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CMPK2 was identified as a specifically expressed core differentially expressed gene (DEG) in the 12-hour post-wound group, where it was down-regulated, and its expression pattern is associated with wound age estimation [Zhu et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2021.101982].