Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000715.4

Sequence Length

2272 nt

GC Content

0.4349

AACCGUCCUUGACCAGCCAACCACAUGGCUGAAAUUCAGGGACUCUUUGGUGGAGCAAUUACCAGUCAACUUCAGGGUAUUAUGAUAAACUCUGAUCUGGGGAGGAACCAGGACUACAUAGAUCAAGGCAGUUUUCUUCUUUGAGAAACUAUCCCAGAUAUCAUCAUAGAGUCUUCUGCUCUUCCUCAACUACCAAAGAAAAACAUCAGCGAAGCAGCAGGCCAUGCACCCCCCAAAAACUCCAUCUGGGGCUCUUCAUAGAAAAAGGAAAAUGGCAGCCUGGCCCUUCUCCAGGCUGUGGAAAGUCUCUGAUCCAAUUCUCUUCCAAAUGACCUUGAUCGCUGCUCUGUUGCCUGCUGUUCUUGGCAAUUGUGGUCCUCCACCCACUUUAUCAUUUGCUGCCCCGAUGGAUAUUACGUUGACUGAGACACGCUUCAAAACUGGAACUACUCUGAAAUACACCUGCCUCCCUGGCUACGUCAGAUCCCAUUCAACUCAGACGCUUACCUGUAAUUCUGAUGGCGAAUGGGUGUAUAACACCUUCUGUAUCUACAAACGAUGCAGACACCCAGGAGAGUUACGUAAUGGGCAAGUAGAGAUUAAGACAGAUUUAUCUUUUGGAUCACAAAUAGAAUUCAGCUGUUCAGAAGGAUUUUUCUUAAUUGGCUCAACCACUAGUCGUUGUGAAGUCCAAGAUAGAGGAGUUGGCUGGAGUCAUCCUCUCCCACAAUGUGAAAUUGUCAAGUGUAAGCCUCCUCCAGACAUCAGGAAUGGAAGGCACAGCGGUGAAGAAAAUUUCUACGCAUACGGCUUUUCUGUCACCUACAGCUGUGACCCCCGCUUCUCACUCUUGGGCCAUGCCUCCAUUUCUUGCACUGUGGAGAAUGAAACAAUAGGUGUUUGGAGACCAAGCCCUCCUACCUGUGAAAAAAUCACCUGUCGCAAGCCAGAUGUUUCACAUGGGGAAAUGGUCUCUGGAUUUGGACCCAUCUAUAAUUACAAAGACACUAUUGUGUUUAAGUGCCAAAAAGGUUUUGUUCUCAGAGGCAGCAGUGUAAUUCAUUGUGAUGCUGAUAGCAAAUGGAAUCCUUCUCCUCCUGCUUGUGAGCCCAAUAGUUGUAUUAAUUUACCAGACAUUCCACAUGCUUCCUGGGAAACAUAUCCUAGGCCGACAAAAGAGGAUGUGUAUGUUGUUGGGACUGUGUUAAGGUACCGCUGUCAUCCUGGCUACAAACCCACUACAGAUGAGCCUACGACUGUGAUUUGUCAGAAAAAUUUGAGAUGGACCCCAUACCAAGGAUGUGAGGCGUUAUGUUGCCCUGAACCAAAGCUAAAUAAUGGUGAAAUCACUCAACACAGGAAAAGUCGUCCUGCCAAUCACUGUGUUUAUUUCUAUGGAGAUGAGAUUUCAUUUUCAUGUCAUGAGACCAGUAGGUUUUCAGCUAUAUGCCAAGGAGAUGGCACGUGGAGUCCCCGAACACCAUCAUGUGGAGACAUUUGCAAUUUUCCUCCUAAAAUUGCCCAUGGGCAUUAUAAACAAUCUAGUUCAUACAGCUUUUUCAAAGAAGAGAUUAUAUAUGAAUGUGAUAAAGGCUACAUUCUGGUCGGACAGGCGAAACUCUCCUGCAGUUAUUCACACUGGUCAGCUCCAGCCCCUCAAUGUAAAGCUCUGUGUCGGAAACCAGAAUUAGUGAAUGGAAGGUUGUCUGUGGAUAAGGAUCAGUAUGUUGAGCCUGAAAAUGUCACCAUCCAAUGUGAUUCUGGCUAUGGUGUGGUUGGUCCCCAAAGUAUCACUUGCUCUGGGAACAGAACCUGGUACCCAGAGGUGCCCAAGUGUGAGUGGGAGACCCCCGAAGGCUGUGAACAAGUGCUCACAGGCAAAAGACUCAUGCAGUGUCUCCCAAACCCAGAGGAUGUGAAAAUGGCCCUGGAGGUAUAUAAGCUGUCUCUGGAAAUUGAACAACUGGAACUACAGAGAGACAGCGCAAGACAAUCCACUUUGGAUAAAGAACUAUAAUUUUUCUCAAAAGAAGGAGGAAAAGGUGUCUUGCUGGCUUGCCUCUUGCAAUUCAAUACAGAUCAGUUUAGCAAAUCUACUGUCAAUUUGGCAGUGAUAUUCAUCAUAAUAAAUAUCUAGAAAUGAUAAUUUGCUAAAGUUUAGUGCUUUGAGAUUGUGAAAUUAUUAAUCAUCCUCUGUGUGGCUCAUGUUUUUGCUUUUCAACACACAAAGCACAAAUUUUUUUUCGAUUAAAAAUGUAUGUAUAAAAAACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-654.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -702.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 530.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((((((.((((((......))))))....)))))))).((((((((((((((..((.(((((....((((((((((((((.....(((((((((((((((...(((((((((..((..(((((((.....((((.(((((...((((...)))))).))).))))....)))).)))..)).....((((.(((......(((((..((((((((.((.((...(((((...........))))).(((....)))....(((...(.(((((((((.......))))))))).)....)))..((((....((..........))....)))))))).)))))))).))))))))))))....))))))))).......(((.(((.((((((((((........(((((((.(((((((......)))....((((......(((((.........(((.....)))....)))))...(((((..((((((.((......))...))))).)..)))))(((((...))))).((((((((.......))))))))...))))...))))))))))))))).))))))))).)))...((((((.....)))))).......((.(((((((.........(((((((((...((((((..((.((.....)).))..)).))))...)))))))))))))))).)).))))))).(((...))).(((((.((((.(((((((.((((((((((((.....(((..(((((((((((((((((((.......((.....)))))))).)))))....)))))).)).......(((((.(((((((...(((((((((.(((........))))))).....((((((((((((((((((.....(((..(((((((((....((.(((.(....).))).))))))))).)))))..)))))))))))........)))))))........((((((....))))))..((((((....((((((((((((((((.((((((((.....))))))...(((.((((((...(((.......)))...))).))).)))...(((((((((........((((((((..(((((.((((((((((......))))))).........))).))))).)))))..)))(((.(((.........))).))).....((((.((.............)))))))))))))))....(.(((((....))))).).((((((((((((((((((((.((.(.(((((.(((((((.................((((....)))).....(((((.......)))))..((((((((.((((.....(((((((((((....))))))))))).....)))))))).)))).....((((.(((((......))))).)))).(((.((..(((......))))).)))....((((((((......)))))))).)).))))).)))))...(((..(((((((...((((((....))))))......)))))))..)))...).)))))))))((((((((((((..(((....(((...(((((((((..((.(((((....((..(((...(((...((((.((.....)))))).))).)))..))..))))))))))))))))....)))...)))..))))).....(((((........)))))))))))).))))))))..))))).............))))))))))))))))))))))))...)))))))))))).)))))((((((((.......(.((((((........)))))).).....(((.....)))))))))))...)))...)))))..........))))))).......(((((((((.............(((......))))))))))))(((((((((((((...)))))............((((((((........))))))))..)))))))).)))))))..))))))))).....))))))))........(((.(((((((...))))))))))....)))))))))..((((.......))))......((((((.....)))))).(((((.........)))))...)))))..)))))...))..)))))).....))).))))).(((.((.(((((......))))).)).)))...........

Thermodynamic Ensemble Prediction

....((((((((.((((((......))))))....))))))))....(((.((((..{,{.(((((((((((((((((.,......,.))))))|,,(((({.(({...,((((((((..(({{(((({((,,,,{{{{{.{||||,..{{{{...}}}}}}.}}}.}))},...||}|||||,,|,.....,,,,,|{,......{|{{|||((((((((({{.{{...(((((...........))))).(((....)))...,|{{...|.(((((((((.......))))))))),|,...}},.,({{{.,..,,,,........)},,}}))))},,}}.,})}|))|}))))},}})))}...))))))))))).))).(((.(((.((((((((((........(((((({{(((({{{......|}}....((((......(((((..,,.....(((.....)))....))))).,((((((..((((((.((......))...))))).)..))))))|{({...})}},.((((((((.......))))))))...))))...))))))))))))))),})))))))).})).,}}}{{(((((,,((((((((({.,,(,.,..,{{{|||,{{{({,,..}}))).,,,|||||......},},,,.}))))}.,))))))))))}}}))))))))))}}}....)))).))}.....((,(((((.((((.(((((((,((((({{.,,,,.}},.{||..(((((((((((((((((((...,...,.....}).)))))).)))))....)))))).)).,,....(((((.(((((((...((((((({(((({.......,)))))))..{{{(((((({(((((((((((...,{(((,...(((((((....({.(((.{....).))).)}))))))).))))...)))))))||||,.......,})))}......,,,|{||{|,,,,))}}}}..(((((,...,((((((((((((((((,({((((((.....))))))...(((.((((((...(((.......)))...)))},)).))).,.(((((((((........((((((((..(((((.((((((((((......))))))).........))).))))).)))))..)))({(,(((,...,,,,.}}}.}}}....,(({{.{{..,,.......,.}})))}))))))))),...{.(((((....))))).}.(((((((((((((,(({{{{,.({({{((({.(((((((.,{{{...........||||(,...,}},.{{{{(((((...,,...||}}|..,||,|||}|||,.....(((((((((((....)))))))))))...,{|||||,,,.))))}},,.((((.(((((......))))).)))).(((.({,.,{{......}}})).)))....((((((((......)))))))).}}.))))).)))},.,.(((..(((((((.,.{(((((,...})))))......)))))))..)))..,||||||||,||(((({{{(((({|,,,{,.,}|||...{{((((((,,,((.{{{{{|||,.{..{,{.,.,.....{(({.{|,,,..}}}}}},|||,,},.|))|.|}})),})))}}}}}|.|.|)))...))}.})))),.....|||||}.},,...}))))))))))).))))))))..)))))...,{{{...}}}))))))))))))))))))))))))...)))))))))))).)))))((((((((.,.....|,((((((.,....,.)))))),|,.....,,..,},.}.))))))))...{{{{.{|,,||....}}..}}))))})}.......(((((((((.............(((......))))))))))))(((((((((((({...}))))............((((((((........))))))))..)))))))).)))))))..))))))))))}{{{{{....,.((((((((((.,(((((({...}))))))|,{....,{,........{{{{.......))),)))))))))),|,,.(((((((({({,,({{{.......,,))}}.,}}|((((({,....|,....)),.....})))})))))))),,||{{((,.......))))}}},.}}},,.........