Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001282.3
Sequence Length
5658 nt
GC Content
0.4648
AGACCUAGAAAAGAAUCGUGACGGGCAGGAAACCAUUACACCACCACCUGGGCUGUGCUCUCCGGCUCCCGCCGCCACCCCCGCCCUCGCCUUCGCCUCCGCCUCCGGUGCACAUUAAAGAUCCAAAGUCAUGACUGACUCCAAGUAUUUCACAACCAAUAAAAAAGGAGAAAUAUUUGAACUAAAAGCUGAACUCAACAAUGAAAAGAAAGAAAAGAGAAAGGAGGCUGUGAAGAAAGUGAUUGCUGCUAUGACCGUGGGGAAGGAUGUUAGUUCUCUCUUUCCAGACGUAGUGAACUGUAUGCAGACUGACAAUCUGGAACUAAAGAAGCUUGUGUAUCUCUACUUGAUGAACUACGCCAAGAGUCAGCCAGACAUGGCCAUCAUGGCUGUAAACAGCUUUGUGAAGGACUGUGAAGAUCCUAAUCCUUUGAUUCGAGCCUUGGCAGUCAGAACCAUGGGGUGCAUCCGGGUAGACAAAAUUACAGAAUAUCUCUGUGAGCCGCUCCGCAAGUGCUUGAAGGAUGAGGAUCCCUAUGUUCGGAAAACAGCAGCAGUCUGCGUGGCAAAACUCCAUGAUAUCAAUGCCCAAAUGGUGGAAGAUCAGGGAUUUCUGGAUUCUCUACGGGAUCUCAUAGCAGAUUCAAAUCCAAUGGUGGUGGCUAAUGCCGUAGCGGCAUUAUCUGAAAUCAGUGAGUCUCACCCAAACAGCAACUUACUUGAUCUGAACCCACAGAACAUUAAUAAGCUGCUGACAGCCCUGAAUGAAUGCACUGAAUGGGGCCAGAUUUUCAUCCUGGACUGCCUGUCUAAUUACAACCCUAAAGAUGAUCGGGAGGCUCAGAGCAUCUGUGAGCGGGUAACUCCCCGGCUAUCCCAUGCCAACUCAGCAGUGGUGCUUUCAGCGGUAAAAGUCCUAAUGAAGUUUCUAGAAUUGUUACCUAAGGAUUCUGACUACUACAAUAUGCUGCUGAAGAAGUUAGCCCCUCCACUUGUCACUUUGCUGUCUGGGGAGCCAGAAGUGCAGUAUGUCGCCCUGAGGAACAUCAACUUAAUUGUCCAGAAAAGGCCUGAAAUCUUGAAGCAGGAAAUCAAAGUCUUCUUUGUGAAGUACAAUGAUCCCAUCUAUGUUAAACUAGAGAAGUUGGACAUCAUGAUUCGUUUGGCAUCUCAAGCCAACAUUGCUCAGGUUCUGGCAGAACUGAAAGAAUAUGCUACAGAGGUGGAUGUUGACUUUGUUCGAAAAGCUGUGCGGGCCAUUGGACGGUGUGCCAUCAAGGUGGAGCAAUCUGCAGAGCGCUGUGUAAGCACAUUGCUUGAUCUAAUCCAGACCAAAGUGAAUUAUGUGGUCCAAGAAGCAAUUGUUGUCAUCAGGGACAUCUUCCGCAAAUACCCCAACAAGUAUGAAAGUAUCAUCGCCACUCUGUGUGAGAACUUAGACUCGCUGGAUGAGCCAGAUGCUCGAGCAGCUAUGAUUUGGAUUGUGGGAGAAUAUGCUGAAAGAAUUGACAAUGCAGAUGAGUUACUAGAAAGCUUCCUGGAGGGUUUUCACGAUGAAAGCACCCAGGUGCAGCUCACUCUGCUUACUGCCAUAGUGAAGCUGUUUCUCAAGAAACCAUCAGAAACACAGGAGCUAGUCCAGCAGGUCUUGAGUUUGGCAACACAGGAUUCUGAUAAUCCUGACCUUCGAGACCGGGGCUAUAUUUAUUGGCGCCUUCUCUCAACUGACCCUGUUACAGCUAAAGAAGUAGUCUUGUCUGAGAAGCCACUGAUCUCUGAGGAGACGGACCUUAUUGAGCCAACUCUGCUGGAUGAGCUAAUCUGCCACAUUGGUUCUUUGGCCUCUGUGUAUCAUAAGCCUCCCAAUGCUUUUGUGGAAGGAAGUCAUGGAAUUCAUCGUAAACACUUGCCAAUUCAUCAUGGGAGCACUGAUGCAGGUGACAGCCCUGUUGGCACUACCACUGCAACGAACCUGGAACAGCCUCAGGUUAUCCCCUCUCAAGGUGAUCUUCUAGGGGAUCUUUUAAACCUUGACCUCGGUCCCCCAGUCAAUGUGCCACAGGUGUCCUCCAUGCAGAUGGGAGCAGUGGAUCUCCUAGGAGGAGGACUAGAUAGUCUGGUGGGACAAUCCUUCAUCCCAUCAUCGGUGCCUGCAACCUUUGCUCCUUCACCUACACCUGCUGUGGUCAGCAGUGGACUGAAUGACCUGUUUGAACUCUCCACAGGGAUAGGCAUGGCACCUGGUGGAUAUGUGGCUCCUAAGGCUGUCUGGCUACCUGCAGUAAAGGCUAAAGGCUUGGAGAUUUCCGGAACAUUUACUCACCGCCAAGGGCACAUCUAUAUGGAAAUGAACUUCACCAAUAAAGCUCUGCAGCACAUGACAGAUUUUGCAAUCCAGUUUAACAAAAAUAGCUUUGGUGUCAUCCCCAGCACUCCUCUGGCCAUCCAUACACCACUGAUGCCAAACCAGAGCAUUGAUGUCUCCCUGCCUCUCAAUACCUUGGGCCCAGUCAUGAAGAUGGAACCUCUGAAUAACCUCCAGGUGGCUGUGAAAAACAAUAUCGAUGUCUUCUACUUCAGCUGCCUCAUCCCACUCAAUGUGCUUUUUGUAGAAGAUGGCAAAAUGGAGCGCCAGGUCUUCCUUGCAACAUGGAAGGAUAUUCCCAAUGAAAAUGAACUUCAGUUUCAGAUUAAGGAAUGUCAUUUAAAUGCUGACACUGUUUCCAGCAAGUUGCAAAACAACAAUGUUUAUACUAUUGCCAAGAGGAAUGUGGAAGGGCAGGACAUGCUGUACCAAUCCCUGAAGCUCACUAAUGGCAUUUGGAUUUUGGCCGAACUACGUAUCCAGCCAGGAAACCCCAAUUACACGCUGUCACUGAAGUGUAGAGCUCCUGAAGUCUCUCAAUACAUCUAUCAGGUCUACGACAGCAUUUUGAAAAACUAACAAGACUGGUCCAGUACCCUUCAACCAUGCUGUGAUCGGUGCAAGUCAAGAACUCUUAACUGGAAGAAAUUGUAUUGCUGCGUAGAAUCUGAACACACUGAGGCCACCUAGCAAGGUAGUAACUAGUCUAACCUGUGCUAACAUUAGGGCACAACCUGUUGGAUAGUUUUAGCUUCCUGUGAACAUUUGUAACCACUGCUUCAGUCACCUCCCACCUCUUGCCACCUGCUGCUGCUAUCUGUCCUUACUUGUGGGCUUCUCCAUGCUGUGCCAAUGGCUGGCUUUUUCUACACCCUCUUUUGAGUGUAGUUUGGUAUUUUGUAAUUGAGAGCUCAUUUCAAAAGCAGAAAAAGACAACAAAUAUUAAAGCAAGGAAAAGUGUAACUGAAACACUGCACUUUACUGUUUUAUACUUUUGUACAUAUGAGAAAUCAAGGGAUUAGUGCAACCAGUAGAAAGCAUUGAAAUGACUGUCAUUAACCACACAGUCCUGGAGGCAGAGAUGCAGUUACCUACCCUAGCUUUUGAUGGGUUCUCUUACCUGUAGUAGCCUUAUCCCUGGUCAUUUGGAUUUUCAGUUUGCUUUUUUCUUUUUUUCCCCUCCAAACUCCUUUUCCUUGGCCAAGCCUUCAUGCUUCCCCCUUUCCAUAUUAUAAUCUCAUUUGAUUGCUCUGCAGUUGGGAACGGUGAUCUUCUUGAAUGAUGUUUCAGUGUGCAAAAACUAUAGAGCCUGUCAGCACCAAAGCUGACAGAAGUUAUACCUUACUCCUUUCCUUUCCCCUGAACAAACCUGCUAAUCCCACUAAUUCAGGAAUUUGAGUAGAGAUGGGGAACAAGAACCCAGAUGCUGUCCCCUCACCCCCUCUCCUGUAUUUCUCAGGUCCAGUUCAAAUCUAAAAUUCUACUUUUAGAGUUGAAACAGAGUAAUAACUUAUCUAACCCUCUUUUCCUACAAAGGAGAAAGAUAAAAGGCACAAAGGUUACCGCCAAGGCCCGUCAGCUGUGUAGUGGCAAAGCCGAGACCGAGUCUCCUAAGUCCCCGUCAGUGUGGUUUUCACCACAGGACUGUCUCUUGUCGUUUUCCCCUAAUGCCUUCUCCUGCCUUUUCUGUGCCUAGUUUUUGGCUCUUCACAUAUUCCAUAUUGAUUUUGACGCUCUGUAUAUUGGCAUCAGGUGGCAGCUGAAUAUCUUUUGAAUUACUCGAAGGUAAAGCCAGAUGCCAGAAUGAAGGUGUAGCCAGUGUUUCCCAUAUGCCCCUGGAGCCCCACUUAUUGAGGCCAGCAGAAUAGGUGCAGAGAUGAAGUGAGCUUAGAGAUGUUGCAAAUGCUCUUUAUCCCUUCAGCUCUCUGAUCUGCUCUUUCUUCAUGAUACUUAGUCUGCAGGGCAUAUUAAGAUCAUCCCAGAGGUUCAGGCAGUUCCUGUCAUCUCUGAAAAGACUGGGGGAUAUGAAAUCUUCCCCCUACCCCACUUAAUGCGUUGGAUAUGAUUUUUCAAAGAAUGCUUCAUGCCCAAAAUACCAGCCUGUUUAGCAGUGUUACACUGUUUGAUCUGCGGGCACUUGUUGCAUUGCCUGGCACCCAAUAUUCAGGGUCCAUGACUAAGACUGGUCUUCUCAGAUGCCCUGCUUAAAUCAGGGGCACUUCAGGCUCCACAGGCGUCAUGUUGGACUGAGACCUAACUCACUGGACUCAGAGGAGGAAUCGUGGAAAACAAGAGCAAAACUACCCCACACCCCUAUUUCAUGUCUGAAAUAACCCUGUUUCAUACCAGUUGCAAAGCUUGUGGGGAGCGGUCCCACAAAGCACUUUCUUAAACCUUGAGAAUCUCCAAGAGAAAAAUAUUUGGGGAAGGAGGGAGGAAAUAUGUCCCUUGCACACCACCCCUGAAGCACAUGGCAGUAGGAAACAGCAUAGGAUUGUAUGUGGGAGGUGGAUAGGUCGGUGAUGUGUGGAGCGGAAAAGCAGGUUGGUAAAGUUCCCUUCUUGGGACUUAUUCCUGGAGUCAGUGGAUACAAGUAGUGCAGAAGGUUCACACUGCAAAUAGUGUUCUCAUCUCA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1731.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1839.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 1457.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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