Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001347466.2
Sequence Length
1414 nt
GC Content
0.6096
ACUCCCACACCAGCUGUUGCUGGGGCAGGACGCCCAAUGUCCCAGUCUUGCUGAAGUCUGCUUGAAAUGUCCCUGGUGAGCUUCUGGCCACUGGGGAAGUUCAGGGGGCAGGUCUGAAGAAGGGGAAGUAGGAAGGGAUGUGAAACUUGGCCACAGCCUGGAGCCACUCCUGCUGGGCAGCCCACAGGGUCCCUGGGCGGAGGGCAGGAGCAUCCAGUUGGAGUUGACAACAGGAGGCAGGUGAGGCCAGAGUCCCAGAGGGAGGGGGCUGCAGAGUUCUGGGACCCAGGGGAGCUGGCCCAGGAGGCUGGGCAGCUGAGGCAGGGAGGGAGGGAAAUAACUGUGCCUGAUUCUAGGACAGGGAUGGGGGUGCAGCACUGAUCCAGGACCCAGAAUGGAGGCAUCAUGGAGGGUCCCCGGGGAUGGCUGGUGCUCUGUGUGCUGGCCAUAUCGCUGGCCUCUAUGGUGACCGAGGACUUGUGCCGAGCACCAGACGGGAAGAAAGGGGAGGCAGGAAGACCUGGCAGACGGGGGCGGCCAGGCCUCAAGGGGGAGCAAGGGGAGCCGGGGGCCCCUGGCAUCCGGACAGGCAUCCAAGGCCUUAAAGGAGACCAGGGGGAACCUGGGCCCUCUGGAAACCCCGGCAAGGUGGGCUACCCAGGGCCCAGCGGCCCCCUCGGAGCCCGUGGCAUCCCGGGAAUUAAAGGCACCAAGGGCAGCCCAGGAAACAUCAAGGACCAGCCGAGGCCAGCCUUCUCCGCCAUUCGGCGGAACCCCCCAAUGGGGGGCAACGUGGUCAUCUUCGACACGGUCAUCACCAACCAGGAAGAACCGUACCAGAACCACUCCGGCCGAUUCGUCUGCACUGUACCCGGCUACUACUACUUCACCUUCCAGGUGCUGUCCCAGUGGGAAAUCUGCCUGUCCAUCGUCUCCUCCUCAAGGGGCCAGGUCCGACGCUCCCUGGGCUUCUGUGACACCACCAACAAGGGGCUCUUCCAGGUGGUGUCAGGGGGCAUGGUGCUUCAGCUGCAGCAGGGUGACCAGGUCUGGGUUGAAAAAGACCCCAAAAAGGGUCACAUUUACCAGGGCUCUGAGGCCGACAGCGUCUUCAGCGGCUUCCUCAUCUUCCCAUCUGCCUGAGCCAGGGAAGGACCCCCUCCCCCACCCACCUCUCUGGCUUCCAUGCUCCGCCUGUAAAAUGGGGGCGCUAUUGCUUCAGCUGCUGAAGGGAGGGGGCUGGCUCUGAGAGCCCCAGGACUGGCUGCCCCGUGACACAUGCUCUAAGAAGCUCGUUUCUUAGACCUCUUCCUGGAAUAAACAUCUGUGUCUGUGUCUGCUGAACAUGAGCUUCAGUUGCUACUCGGAGCAUUGAGAGGGAGGCCUAAGAAUAAUAACAAUCCAGUGCUUAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-622.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -648.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...(((((....)))))(((.....)))((((((.(((((...((((((((............(((((((((.(((...)))))))))))).((((((.(((((.(.....(((.(......((((((((((((((..((((((((...((((...(((.((((((((.....(((((..((...)))))))....))))))))..(((.((((.......)))).))))))))))..))))))..((((...)))).(((((.((..(((((((((.......(((((((((((......((.(((((((((((((((((((..(((.......(((.((((....)))))))((((.((((((.(..(.(((...((((..(((...))).(((((((((((((....((((.((((((((((((.....))))))))))..)).))))))))))))))).))........((((...))))((((.(((((((..((((((((..(((((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((((((...(((.((((((....)))))).)))(((((((((......(((((........((((((((...(((((((((..(((..((((.....)).))..).)).)))))))))...)))))).))..((((.((...)))))).....))))).(((.(((((((((.((((......((....(((((.((.(((.....((((((....)))))).((((((...))))))....(((((..(((.....(((((.....((.....))....)))))...))))))))....((.((....)).)).)))..)))))))....))........)))).)).)))))))...)))......)))))))))...).))))))))...)))))).)))....)))))))...((((((.((((((((((...(((.....)))...)))))))))))))))).((.(((.......))).))((....))..)))))(((.(((...(((((......)))))...))))))..((((....))))..))).))))))....)))))))).))))))).))))))))...))).)..).))))))))))...))).))))))(((...))).((.((.((........)).)).))...)))))))))))))..)).....)))))))))))......))))))))).)).)))))))..)))))..((((((((......)))))))).))))))))).......).))).....).))))).))))))....))))))))....))).)).))))))...)))))................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((...(((((....)))))(((.....)))((((((|(|(((...((((((({,...........(((((((((.(((...)))))))))))).{(((((,((({({(,{,,,(((,{,,,...(((({(((((((((..((((((((.,.((((,..(((.((((((((.,,..((((...||...)))))))},.,))))))}}..(((.((((.......)))).)))})))))),.)))))}..((((...)))).(((((.((..(((((((((.{.,...(((((((((((......{(.(((((((((((((((((((..(((......,(((.((((....)))))))|(((.((((((.(..(.(((.,.((((..(({...})).(((((((((((((....((((.((((((((((((.....))))))))))..)).))))))))))))))).))........((((...))))((((.(((((((..((((((((..(((((((((.,...,((((((((((.((((((.(((((((({...(((,((((((....)))))).)))(((((((((,,,...(((((........((((((((..,(((((((({..((...{(((,.....},))).,.}),))))))))).,.)))))).))..((((.((...)))))).....})))).{{{.(((((((((.((((......((....(((((.((.(((.....((((((....)))))).((((((...))))))....(((((..(((..,..(((((,.{{.({.....))..},)))))..,))))))))...{((,{....}}).},.)))..)})))))....,,.,......)))).)).)))))))...)))},....)))))))))...}.))))))))...)))))).))),...})))))),,,((((((.((((((((((...{(({....)))...)))))))))),))))).((,(((,,,,,..}|}.},{({{,,||..}||||(({|||,...{{{{{......})))).,..,,})),,||||},},))))..))).))))))....)))))))).))))))).)))))))).,.))).}..).))))))))))...))).))))))}{({,,||,.||,,(,((,.,....})})))}},...,)))))))))))).,,}.....)))))))))))..,.}.))))))))).)).)))))))..))))).,|||{{{{{,,,,.}))))))))}))))))))),......}.}}}.,,,|},}}}}}.}}))))...,))))))))....))).))}})))))...))))).,.{..,...............,.,},,....
Back