Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_015991.4

Sequence Length

1091 nt

GC Content

0.6095

ACUCCUGCUGGGCAGCCCACAGGGUCCCUGGGCGGAGGGCAGGAGCAUCCAGUUGGAGUUGACAACAGGAGGCAGAGGCAUCAUGGAGGGUCCCCGGGGAUGGCUGGUGCUCUGUGUGCUGGCCAUAUCGCUGGCCUCUAUGGUGACCGAGGACUUGUGCCGAGCACCAGACGGGAAGAAAGGGGAGGCAGGAAGACCUGGCAGACGGGGGCGGCCAGGCCUCAAGGGGGAGCAAGGGGAGCCGGGGGCCCCUGGCAUCCGGACAGGCAUCCAAGGCCUUAAAGGAGACCAGGGGGAACCUGGGCCCUCUGGAAACCCCGGCAAGGUGGGCUACCCAGGGCCCAGCGGCCCCCUCGGAGCCCGUGGCAUCCCGGGAAUUAAAGGCACCAAGGGCAGCCCAGGAAACAUCAAGGACCAGCCGAGGCCAGCCUUCUCCGCCAUUCGGCGGAACCCCCCAAUGGGGGGCAACGUGGUCAUCUUCGACACGGUCAUCACCAACCAGGAAGAACCGUACCAGAACCACUCCGGCCGAUUCGUCUGCACUGUACCCGGCUACUACUACUUCACCUUCCAGGUGCUGUCCCAGUGGGAAAUCUGCCUGUCCAUCGUCUCCUCCUCAAGGGGCCAGGUCCGACGCUCCCUGGGCUUCUGUGACACCACCAACAAGGGGCUCUUCCAGGUGGUGUCAGGGGGCAUGGUGCUUCAGCUGCAGCAGGGUGACCAGGUCUGGGUUGAAAAAGACCCCAAAAAGGGUCACAUUUACCAGGGCUCUGAGGCCGACAGCGUCUUCAGCGGCUUCCUCAUCUUCCCAUCUGCCUGAGCCAGGGAAGGACCCCCUCCCCCACCCACCUCUCUGGCUUCCAUGCUCCGCCUGUAAAAUGGGGGCGCUAUUGCUUCAGCUGCUGAAGGGAGGGGGCUGGCUCUGAGAGCCCCAGGACUGGCUGCCCCGUGACACAUGCUCUAAGAAGCUCGUUUCUUAGACCUCUUCCUGGAAUAAACAUCUGUGUCUGUGUCUGCUGAACAUGAGCUUCAGUUGCUACUCGGAGCAUUGAGAGGGAGGCCUAAGAAUAAUAACAAUCCAGUGCUUAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-467.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -486.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 251.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((..(.((((((.((.((.(((((((......((((.(((((((((.((((.......)))).))((((((((((((((((((((....((((.((((((((((((.....))))))))))..)).))))))))))))))).)).....((.((((...)))).))..(((((((..((((((((..(((((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((((((...(((.((((((....)))))).)))(((((((((......(((((........((((((((...(((((((((..(((..((((.....)).))..).)).)))))))))...)))))).))..((((.((...)))))).....))))).(((.(((((((((.((((......((....(((((.((.(((.....((((((....)))))).((((((...))))))....(((((..(((.....(((((.....((.....))....)))))...))))))))....((.((....)).)).)))..)))))))....))........)))).)).)))))))...)))......)))))))))...).))))))))...)))))).)))....)))))))...((((((.((((((((((...(((.....)))...)))))))))))))))).((.(((.......))).))((....))..)))))(((.(((...(((((......)))))...))))))..((((....))))..))).))))))....)))))))).))))))).)))))))((((((((((.((.................))))))))))))..)))))))))))......))))))).))..)).....)))))).).)))))((((((.........))))))((.(((((..(((((.(..((.(((((((..((((((((((((.(((((.....(.((((.......)))).).....)))))..))).)))))))))(((....))).)))))))))..).)).))).................))))).)).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((,,{,(((((({,..{{,(((((((,,,...((((.(((((((((.((((.......)))).))((((((((((((((((((((....((((.((((((((((((.....))))))))))..)).))))))))))))))).)).....((.((((...)))).)).,(((((((..((((((((..(((((((((.,...,((((((((((.((((((.(((((((({...(((,((((((....)))))).)))(((((((((,,,...(((((........((((((((..,(((((((({..((...{(((,.....},))).,.}),))))))))).,.)))))).))..((((.((...)))))).....})))).{{{.(((((((((.((((......((....(((((.((.(((.....((((((....)))))).((((((...))))))....(((((..(((..,..(((((,.{{.({.....))..},)))))..,))))))))...{((,{....}}).},.)))..)})))))....,,.,......)))).)).)))))))...)))},....)))))))))...}.))))))))...)))))).))),...})))))),,,((((((.((((((((((...{(({....)))...)))))))))),))))).((,(((,,,,,..}|}.},{({{,,||..}||||(({|||,...{{{{{......})))).,..,,})),,||||},},))))..))).))))))....)))))))).))))))).)))))))((((((((({,((....,.,..........}})))))))))}..})))))))))}......})))))),|}..|}|,,{{|}},)),),)}))}((((((..,......)))))){|.{{|||}|||||{,|..((,({(((((..((((((((((((.(((((,......,||{.......}}}}.},..}.)))))..))).))))))))){({....})}.)))))))})..},)).)}}....,............}}))).)).....